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羊草LVAP1基因的克隆及生物信息学分析
引用本文:吕召志,冯树丹,于莹,李蕊沁,黎莉,徐明华,韩四平,尹悦佳. 羊草LVAP1基因的克隆及生物信息学分析[J]. 哈尔滨商业大学学报(自然科学版), 2010, 26(6)
作者姓名:吕召志  冯树丹  于莹  李蕊沁  黎莉  徐明华  韩四平  尹悦佳
基金项目:吉林省省长基因项目(应用转基因等生物技术培育抗盐碱优质玉米种质
摘    要:克隆羊草VHA-c基因并预测其编码蛋白质结构和功能.由羊草总RNA经RACE克隆获得VHA-c基因cDNA,采用生物信息学方法预测蛋白结构和功能.获得羊草VHA-c基因cDNA,命名为LVAP1基因(GenBank登录号为GQ397276),LVAP1基因开放阅读框为498 bp,编码165个氨基酸,有4个α-螺旋跨膜结构域,在第4个结构域上含有一个高度保守的G lu142残基,推测它是质子的结合位点.进化树分析显示,羊草LVAP1蛋白与小麦、碱蓬和冰叶日中花等植物的VHA-c蛋白具有高度的同源性,推测LVAP1亚基与其他VHA-c亚基执行相似的功能.

关 键 词:LVAP1基因  克隆  生物信息学

Cloning and bioinformatics analysis of LVAP1 gene and product protein in leymus chinensis
LV Zhao-zhi,FENG Shu-dan,YU Ying,LI Rui-qin,LI Li,XU Ming-hua,HAN Si-ping,YIN Yue-yia. Cloning and bioinformatics analysis of LVAP1 gene and product protein in leymus chinensis[J]. Journal of Harbin University of Commerce :Natural Sciences Edition, 2010, 26(6)
Authors:LV Zhao-zhi  FENG Shu-dan  YU Ying  LI Rui-qin  LI Li  XU Ming-hua  HAN Si-ping  YIN Yue-yia
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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