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蛋白质β-折叠二聚体结合能的理论研究
引用本文:孙长亮,王长生.蛋白质β-折叠二聚体结合能的理论研究[J].中国科学B辑,2009,39(6):481-487.
作者姓名:孙长亮  王长生
作者单位:辽宁师范大学化学化工学院, 大连 116029
基金项目:致谢 本工作得到国家自然科学基金(批准号:20573049,20633050)、辽宁省教育厅基金(批准号:20060469)和辽宁省高校创新团队基金(批准号:2007T091)项目资助,特此一并致谢.
摘    要:使用B3LYP和MP2方法研究了17个由甘氨酸多肽构成的具有反平行结构和平行结构的肛折叠二聚体.估算了在反平行结构中存在的H…H,O…O二级静电排斥作用的大小.并以LR,SR,MR为结构单元探讨了肽链长度的增加对体系的结合能的影响.结果表明在反平行的肛折叠二聚体中,由于二级静电作用的影响,随着肽链长度的增加,体系的结合能是以折线形式增强的,而在平行结构中,体系的结合能随着肽链长度的增加呈线性增强关系.

关 键 词:β-折叠二聚体  氢键  结合能
收稿时间:2008-12-03
修稿时间:2009-02-25
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