| 氨基酸残基延展态可及表面积的预测 |
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| 引用本文： | 李艳红,王永华,李燕,杨胜利,杨凌.氨基酸残基延展态可及表面积的预测[J].分子科学学报,2007,23(3):170-175. |
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| 作者姓名： | 李艳红 王永华 李燕 杨胜利 杨凌 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院大连化学物理研究所药用资源开发研究组,辽宁,大连,116023
2. 大连理工大学化工学院化学工艺教研室,辽宁,大连,116012 |
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| 基金项目： | 国家“863”计划项目(2003AA223061)，中科院大连化物所创新基金资助项目，大连理工大学-中科院大连化学物理研究所合作科研探索基金资助项目 |
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| 摘 要： | 氨基酸残基的延展态可及表面积(ASA)对预测蛋白质结构和功能起着至关重要的作用.采用偏最小二乘法和多元回归法成功构建了具有较高准确率的预测氨基酸延展态ASA的模型.所得模型具有良好的预测性和可重复性,在模型中,训练集的最优Rt2r可以达到0.998 3,而测试集的Rt2e最优可以达到0.999 2.
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| 关 键 词： | 氨基酸 延展态可及表面积 参数 偏最小二乘法 |
| 文章编号： | 1000-9035（2007）03-0170-06 |
| 修稿时间： | 2007-01-16 |
Prediction of extended state accessible surface area of amino acids |
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| LI Yan-hong,WANG Yong-hua,LI Yan,YANG Sheng-li,YANG Ling.Prediction of extended state accessible surface area of amino acids[J].Journal of Molecular Science,2007,23(3):170-175. |
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| Authors: | LI Yan-hong WANG Yong-hua LI Yan YANG Sheng-li YANG Ling |
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| Institution: | 1. Laboratory of Pharmaceutical Resource Discovery, Dalian Institute of Chemical Physics,The Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China;2. Department of Chemical Technology, Dalian University of Technology,Dalian 116012,China |
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| Abstract: | Extended state accessible surface area(ASA) is a key property of amino acid residues,important for predicting both the structure and function of proteins.In this study,utilizing the partial least square(PLS) and multiple regression,an accurate model was built for the prediction of extended state accessible surface area of 20 amino acids.These models exhibited proper predictability and reliability:R2tr is 0.998 3 for training set and R2te is 0.999 2 for testing set. |
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| Keywords: | amino acid extended state accessible surface area scales partial least squares |
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