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MDM2与抑制剂PDIQ作用机制的结合自由能计算研究
引用本文:
时术华,张庆刚,张少龙. MDM2与抑制剂PDIQ作用机制的结合自由能计算研究[J]. 原子与分子物理学报, 2014, 31(6): 618-623
作者姓名:
时术华
张庆刚
张少龙
作者单位:
山东师范大学,山东师范大学
基金项目:
国家自然科学基金,省市自然科学基金
摘 要:
p53-MDM2之间的相互作用是抗癌药物设计的重要靶标。采用分子动力学模拟和结合自由能计算研究抑制剂PDIQ与MDM2的结合模式,结果显示范德华作用是二者结合的主体力量。基于残基的自由能分解计算结果表明CH-CH、CH-π和π-π相互作用驱动了二者的结合。这一研究成果可为抗癌药物的设计提供理论上的指导。
关 键 词:
分子动力学;结合自由能;结构-亲和能关系;p53-MDM2相互作用
Binding free energy insight into interaction mechanism of inhibitor PDIQ with MDM2
Abstract:
Keywords:
Molecular dynamics
Binding free energy
structure-affinity relation
p53-MDM2 interaction
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