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分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用
引用本文:孙浩,蒋勇军,俞庆森,邹建卫.分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用[J].物理化学学报,2009,25(4).
作者姓名:孙浩  蒋勇军  俞庆森  邹建卫
作者单位:1. 浙江大学化学系,杭州,310027
2. 浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室,浙江,宁波,315100
3. 浙江大学化学系,杭州,310027;浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室,浙江,宁波,315100
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划),国家自然科学基金 
摘    要:用分子动力学模拟的方法揭示了结构水分子在糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)中的作用.如果没有结构水,ATP嘌呤环的结合位置将发生偏移以填补结构水留下的空间;ATP结合口袋中的氢键网络将被破坏,保守残基Lys85与ATP的磷酸根侧链只能形成一个保守氢键,无法维持磷酸根转移所需的线性关系;由于失去了氢键网络的稳定作用,Glu97和Lys85会向远离ATP的方向移动,并导致Arg96的侧链发生偏转,使Arg96无法保持与Arg180和Lys205之间正常的相对位置,最终影响GSK-3β与底物的结合.

关 键 词:糖原合成酶激酶-3β  结构水分子  分子动力学模拟

Molecular Dynamics Simulation of Significant Roles of Structural Water Molecules in Glycogen Synthase Kinase-3β
SUN Hao,JIANG Yong-Jun,YU Qing-Sen,ZOU Jian-Wei.Molecular Dynamics Simulation of Significant Roles of Structural Water Molecules in Glycogen Synthase Kinase-3β[J].Acta Physico-Chimica Sinica,2009,25(4).
Authors:SUN Hao  JIANG Yong-Jun  YU Qing-Sen  ZOU Jian-Wei
Abstract:
Keywords:
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
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