| 拟南芥psrp-3基因的PCR扩增与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王耘,王媛,王永华,丁君,丛玉婷.拟南芥psrp-3基因的PCR扩增与生物信息学分析[J].分子科学学报,2010,26(2). |
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| 作者姓名： | 王耘 王媛 王永华 丁君 丛玉婷 |
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| 作者单位： | 1. 南京中医药大学第二临床医学院,江苏,南京,210029
2. 大连水产学院生命科学与技术学院,辽宁,大连,116021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，大连市青年基金资助项目，辽宁省水生生物学重点实验室资助项目，南京中医药大学青年基金资助项目，江苏省中管局资助项目 |
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| 摘 要： | 采用PCR法获得拟南芥叶绿体核糖体psrp-3基因序列并进行生物信息学分析.根据psrp-3基因序列保守区设计2对引物,通过RT-PCR获得预期大小的基因序列,琼脂糖凝胶电泳鉴定目的片段.利用生物信息学软件对拟南芥psrp-3基因序列进行同源比对、氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、蛋白质功能及系统进化分析和预测.结果表明,RT-PCR获得了一段753 bp的序列,psrp-3蛋白是等电点为9.27的亲水性稳定蛋白,包含一个结构域和一个区域,α螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,β折叠和伸展链散布其中,和菠菜、葡萄、蓖麻、大豆等的psrp-3蛋白有较高的同源性.为进一步了解psrp-3基因的功能和作用机制打下基础.
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| 关 键 词： | 拟南芥 叶绿体 psrp-3基因 |
PCR amplification and bioinformatics analysis of psrp-3 gene from arabidopsis thaliana |
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| WANG Yun,WANG Yuan,WANG Yong-hua,DING Jun,CONG Yu-ting.PCR amplification and bioinformatics analysis of psrp-3 gene from arabidopsis thaliana[J].Journal of Molecular Science,2010,26(2). |
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| Authors: | WANG Yun WANG Yuan WANG Yong-hua DING Jun CONG Yu-ting |
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