| 氨基酸描述子VHSEH用于多肽定量序效建模研究 |
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| 引用本文： | 杨善彬,夏之宁,舒茂,梅虎,吕凤林,张梅,吴玉乾,李志良. 氨基酸描述子VHSEH用于多肽定量序效建模研究[J]. 高等学校化学学报, 2008, 29(11): 2213-2217 |
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| 作者姓名： | 杨善彬 夏之宁 舒茂 梅虎 吕凤林 张梅 吴玉乾 李志良 |
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| 作者单位： | 重庆大学生物工程学院化学化工学院,重庆,400044;重庆大学化学化工学院,重庆,400044;宜宾学院化学与化工系,宜宾;644000;重庆大学生物工程学院化学化工学院,重庆,400044;重庆大学化学化工学院,重庆,400044;第三军医大学野战外科研究所,重庆,400038;重庆大新药业有限公司质检部,重庆,400700;重庆大学化学化工学院,重庆,400044 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) ， 化学生物传感与计量学国家重点实验室开放基金 |
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| 摘 要： | 从20 种天然氨基酸的171个物化性质出发, 按照疏水、立体和电性特征及氢键贡献将其分类后, 分别进行主成分分析, 得到一个新描述子VHSEH(Principal component score vector of hydrophobic, steric, electronic properties and, hydrogen bonds contributions). 对后叶催产素的结构进行了表征, 并以偏最小二乘法及D-优化划分样本建立了PLS定量序效关系模型, 得到复相关系数R2分别为 0.958 和 0.957, Q2分别为0.903和0.845, 约高于VHSE描述子模型值; 对抗菌肽进行了结构表征, 建立了PLS和OSC-PLS模型, 其R2分别为0.84和 0.995, Q2分别为0.546和0.926, 较SZOTT描述子结果好; 对58 个血管紧张素转化酶抑制剂进行QSAM研究, 得到R2, Q2及RMS分别为0.877, 0.838和0.361. 研究结果表明, VHSEH 描述子信息量大, 物化意义明确, 结果更易解释.
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| 关 键 词： | 氨基酸描述子(VHSEH) 肽 定量序效建模(QSAM) 偏最小二乘法 |
| 收稿时间： | 2008-01-29 |
VHSEH Descriptors for the Development of QSAMs of Peptides |
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| YANG Shan-Bin,XIA Zhi-Ning,SHU Mao,MEI Hu,LV Feng-Lin,ZHANG Mei,WU Yu-Qian,LI Zhi-Liang. VHSEH Descriptors for the Development of QSAMs of Peptides[J]. Chemical Research In Chinese Universities, 2008, 29(11): 2213-2217 |
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| Authors: | YANG Shan-Bin XIA Zhi-Ning SHU Mao MEI Hu LV Feng-Lin ZHANG Mei WU Yu-Qian LI Zhi-Liang |
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| Affiliation: | College of Bioengineering, ;College of Chemistry and Chemical Engineering, Chongqing University, Chongqing 400030, China; ;Faculty of Clinical Laboratory Sciences, PLA Third Military Medical University, Chongqing 400038, China; ;Department of Chemistry and Chemical Engineering, Yibin University, Yibin, Sichuan 644000, China;;Department of Quality Control, Chongqing Daxin Pharmaceutical Co. Ltd., Chongqing 400700, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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