| p53-MDM2相互作用的分子力学和动力学研究 |
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| 引用本文： | 程伟渊,梁志强,张庆刚,伊长虹,王伟,王克彦.p53-MDM2相互作用的分子力学和动力学研究[J].原子与分子物理学报,2012,29(6):393-399. |
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| 作者姓名： | 程伟渊 梁志强 张庆刚 伊长虹 王伟 王克彦 |
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| 作者单位： | 山东交通学院外语系,上东交通学院数理系,上东交通学院数理系,山东交通学院数理系,山东交通学院数理系,山东师范大学物理与电子科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(Nos. 10874104和11104164) |
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| 摘 要： | p53-MDM2相互作用的抑制已经成为治疗癌症的新方法. 本文将分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics/passion-Boltzman surface area)方法结合起来研究MDM2-p53相互作用机制. 结果证明范德华相互作用驱动了MDM2与p53的结合. 基于残基-残基相互作用的计算不仅证明p53的三个残基Phe19′, Trp23′和Leu26′与MDM2有较强的相互作用，而且还发现另外两个残基Leu22′和Pro27′也与MDM2有较强的相互作用，这为抗癌药物的设计提供了新靶标. 同时也证明CH-CH，CH-π和π-π相互作用驱动了p53在MDM2疏水性裂缝中的结合.
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| 关 键 词： | 分子动力学 MM-PBSA 结合自由能 p53-MDM2相互作用 氢键动力学 |
| 收稿时间： | 9/7/2011 2:08:35 PM |
Insight into p53-MDM2 Interaction Based on Molecular Dynamics Simulation and Molecular Mechanics |
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| chengweiyuan.Insight into p53-MDM2 Interaction Based on Molecular Dynamics Simulation and Molecular Mechanics[J].Journal of Atomic and Molecular Physics,2012,29(6):393-399. |
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| Authors: | chengweiyuan |
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| Keywords: | molecular dynamics binding free energy MM-PBSA p53-MDM2 interaction hydrogen bond |
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