| 应用独立成分分析方法预测CTL表位 |
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| 引用本文： | 董素梅,宋哲,刘涛,朱鸣华,刘伟.应用独立成分分析方法预测CTL表位[J].化学学报,2010,68(18):1821-1828. |
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| 作者姓名： | 董素梅 宋哲 刘涛 朱鸣华 刘伟 |
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| 作者单位： | (1大连理工大学高科技研究院 大连 116023)
(2大连理工大学物理与光电工程学院 大连 116023)
(3大连交通大学理学院 大连 116028) |
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| 摘 要： | 基于独立成分分析方法分别采用3 z-scale和5 z-scale氨基酸结构描述符, 建立了抗原肽与MHC分子(major histocompatibility complex, MHC)相互作用结合的定量构效关系模型. 该两个模型训练集样本数是316, 预测集样本数是786. 结果表明: 3 z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.3%, 0.70; 5 z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.9%, 0.79. 本文建立CTL表位预测模型对进一步了解抗原肽与MHC I类分子相互作用机理具有一定的帮助.
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| 关 键 词： | CTL表位 独立成分分析 氨基酸描述符 定量构效关系 |
Prediction of the CTL Epitope Based on Independent Component Analysis Method |
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| Dong,Sumei,Song,Zhe,Liu,Tao,Zhu,Minghua,Liu,Wei.Prediction of the CTL Epitope Based on Independent Component Analysis Method[J].Acta Chimica Sinica,2010,68(18):1821-1828. |
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| Authors: | Dong Sumei Song Zhe Liu Tao Zhu Minghua Liu Wei |
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| Institution: | (1 College of Advanced Science and Technology, Dalian University of Technology, Dalian 116023)
(2 Department of Physics, Dalian University of Technology, Dalian 116023)
(3 School of Science, Dalian Jiaotong University, Dalian 116028) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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