| 分子动力学模拟研究点突变(Met108→Leu108)对树胶醛糖结合蛋白与配体作用的影响 |
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| 作者姓名： | 冯献礼 李卓 赵熹 于辉 刘慧玲 黄旭日 |
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| 作者单位： | 1. 吉林大学理论化学研究所, 理论化学计算国家重点实验室, 长春 130021;
2. 北华大学化学与生物学院, 吉林 132013 |
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| 基金项目： | 国家“九七三”计划项目（批准号：2012CB932800）和国家自然科学基金（批准号：21173097,21103066）资助. |
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| 摘 要： | 为了研究点突变(Met108→Leu108)对树胶醛糖结合蛋白(ABP)与配体结合能力的影响,对ABP、ABP结合树胶醛糖复合物及ABP结合半乳糖复合物以及它们各自的突变体分别进行60 ns的分子动力学模拟.模拟结果表明,108号残基突变前后,电子等排体的两个氨基酸残基,使蛋白与配体间的范德华相互作用发生明显变化,同时导致蛋白的内部运动也发生变化,进而影响蛋白与配体的相互作用.进一步分析表明,突变前后的蛋白构象变化都趋向于两个结构域张开,而与配体的结合可减缓张开程度.
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| 关 键 词： | 树胶醛糖结合蛋白 分子动力学 非极性相互作用 |
| 收稿时间： | 2013-09-11 |
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