单碱基多样性的非测序检测(英文) |
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引用本文: | 徐天启,尹芳菲,张晓华,左小磊.单碱基多样性的非测序检测(英文)[J].化学通报,2020(6):497-507. |
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作者姓名: | 徐天启 尹芳菲 张晓华 左小磊 |
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作者单位: | 1. 上海交通大学医学院分子医学研究院上海交通大学医学院附属仁济医院神经外科;2. 中国科学院上海应用物理研究所物理生物学研究室中科院微观界面物理与探测重点实验室;3. 中国科学院大学 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81601061,81971093)资助; |
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摘 要: | 单碱基多样性(SNP)是最常见的基因突变形式之一,经研究证明与很多疾病相关。虽然测序是检测SNP的重要方法,但其需要检测仪器,且检测时间较长,限制了其临床应用。本文综述了SNP的常见非测序分析方法。首先讨论了检测的热力学问题,并归纳了三类主要的检测策略:基于杂交的检测、基于链取代反应的检测和酶介导的检测。在三维均相检测方法中,主要介绍了不同信号开关策略,如荧光开关、酶识别开关和场效应开关。三维原位检测不仅能检测SNP,还能提供其细胞定位信息,在细胞异质性较高时更具优势。二维界面检测的识别反应速率和杂交效率受到一定影响,但界面检测能进一步减小干扰,亦便于实现高通量检测;以DNA正四面体探针界面为代表的改良界面具有优良的灵敏度和特异性。同时,本文亦讨论了现有方法的局限性,并对SNP非测序检测研究进行展望。
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关 键 词: | 单碱基多样性 非测序检测 均相检测 原位检测 界面检测 |
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