基于质谱数据的计算代谢组学方法学研究进展 |
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引用本文: | 杨军,刘心昱,许国旺.基于质谱数据的计算代谢组学方法学研究进展[J].中国科学:化学,2022(9):1580-1591. |
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作者姓名: | 杨军 刘心昱 许国旺 |
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作者单位: | 1. 中国科学院分离分析化学重点实验室中国科学院大连化学物理研究所;2. 中国科学院大学 |
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基金项目: | 国家自然科学基金委(编号:21876169,21934006); |
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摘 要: | 代谢组学旨在对代谢组进行全景的分析,从而发现生物现象或规律.由于代谢物的种类和数量都非常庞大,对代谢组的分析高度依赖于分析仪器和方法.质谱是代谢组分析最有用的工具,超高效液相色谱-高分辨质谱可以从生物样品中获得大量的代谢物离子特征,获得丰富的代谢组信息,但如何对质谱数据进行挖掘和利用仍面临极大的挑战.计算代谢组学可以充分利用质谱采集的数据,结合统计、化学计量学、人工智能等方法实现对代谢组学数据的高效处理和分析,推动代谢组学的发展.本文在给出代谢组数据特点的基础上,综述了数据驱动的计算代谢组学方法学进展,包括特征提取、代谢物的注释和鉴定,并简要介绍了知识辅助的计算代谢组学方法,最后对计算代谢组学方法学下一步的发展进行了展望.
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关 键 词: | 计算代谢组学 质谱 特征提取 代谢物注释与鉴定 |
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