| 二氧化硫分子通过增强二次成核促进纤维的生长:基于分子动力学的模拟研究 |
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| 引用本文： | 康文斌,夏耘,王骏,王炜.二氧化硫分子通过增强二次成核促进纤维的生长:基于分子动力学的模拟研究[J].化学学报,2016,74(8):694-702. |
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| 作者姓名： | 康文斌 夏耘 王骏 王炜 |
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| 作者单位： | a 南京大学 物理学院 南京 210093;
b 湖北医药学院 公共卫生与管理学院 十堰 442000;
c 南京大学 固体微结构国家重点实验室 南京 210093;
d 南京大学 人工微结构科学与技术协同创新中心 南京 210093 |
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| 基金项目： | 项目受国家自然科学基金（Nos. 11334004，11174133，81421091）和国家科技部973项目（No. 2013CB834100）资助. |
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| 摘 要： | 空气污染是一种常见的现象. 空气污染物是诱发各类疾病的重要因素之一. 以二氧化硫分子为代表，研究了它与Aβ17～42原纤维之间的相互作用. 伞形抽样模拟表明，二氧化硫分子的引入减少了纤维的解离自由能. 分析各氨基酸残基结合二氧化硫的频数得知，二氧化硫分子更容易动态地结合到疏水性氨基酸残基的骨架上，同时也容易结合到带电的氨基酸残基上进而削弱盐桥相互作用，但是对这些相互作用的削弱是非常微小的，不足以破坏原纤维的结构. 通过非线性主方程分析，我们发现二氧化硫分子加速了Aβ17～42二次成核过程，同时缩短了迟滞时间而加速纤维的聚集过程. 通过这些计算，我们定量地揭示了空气污染物与蛋白质相互作用的特征，期望我们的结果为当今社会评估污染物的健康效应提供宝贵的参考信息.
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| 关 键 词： | 二氧化硫 淀粉样纤维 分子动力学模拟 解离自由能 二次成核 |
Sulfur Dioxide Promotes the Formation of Amyloid Fibrils through Enhanced Secondary Nucleation: A Molecular Dynamics Study |
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| Kang Wenbin,Xia Yun,Wang Jun,Wang Wei.Sulfur Dioxide Promotes the Formation of Amyloid Fibrils through Enhanced Secondary Nucleation: A Molecular Dynamics Study[J].Acta Chimica Sinica,2016,74(8):694-702. |
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| Authors: | Kang Wenbin Xia Yun Wang Jun Wang Wei |
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| Institution: | a School of Physics, Nanjing University, Nanjing 210093, China;
b School of Public Health and Management, Hubei University of Medicine, Shiyan 442000, China;
c National Laboratory of Solid State Microstructure, Nanjing University, Nanjing 210093, China;
d Collaborative Innovation Center of Advanced Microstructures, Nanjing University, Nanjing 210093, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sulfur dioxide amyloid fibril molecular dynamic simulation dissociation free energy secondary nucleation |
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