| 分子模拟用于尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性CTL表位的筛选 |
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| 引用本文： | 曹凯,黄路,林治华,舒勇,韩智敏,黄山虎,廖翔,王远强,彭方毅,安洪.分子模拟用于尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性CTL表位的筛选[J].化学学报,2010,68(13):1277-1284. |
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| 作者姓名： | 曹凯 黄路 林治华 舒勇 韩智敏 黄山虎 廖翔 王远强 彭方毅 安洪 |
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| 作者单位： | (1南昌大学第一附属医院 南昌 330006)(2江西省妇幼保健院 南昌 330006)(3重庆理工大学化学与生物工程学院 重庆 400050)(4重庆医科大学附属第一医院 重庆 400016)5. 重庆理工大学
6. 重庆理工大学化学与生物工程学院 |
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| 摘 要： | 为获得尤文肉瘤EWS-FLI1融合蛋白有效的HLA-A2.1限制性CTL表位, 综合运用BIMAS, SYFPEITHI, Predep和IEDB方案对EWS-FLI1进行CTL表位的预测, 得出8个CTL表位9肽序列; 应用多项式方案、量化基序方案对8个表位9肽进一步进行筛选, 获得其中4个9肽序列, 并进一步运用分子模拟方法初步模拟了4个表位肽与HLA-A2.1分子间的相互结合作用; 应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽, RP-HPLC与MS分别鉴定合成肽的纯度与分子量; 通过亲和力实验验证了表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)与HLA-A2.1有较强的结合力, 从而为表位肽的后继免疫学特性研究提供了基础. 本研究提供了一个合理高效的表位筛选方法.
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| 关 键 词： | 尤文肉瘤 EWS-FLI1融合蛋白 CTL表位 分子动力模拟 |
Screening of HLA-A2.1-Restricted CTL Epitopes Derived from Ewing's Sarcoma EWS-FLI1 Fusion Protein by Using Molecular Simulation |
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| Cao Kai,Huang Lu,Lin Zhihua,Shu Yong,Han Zhimin,Huang Shanhu,Liao Xiang,Wang Yuanqiang,Peng Fangyi,An Hong.Screening of HLA-A2.1-Restricted CTL Epitopes Derived from Ewing's Sarcoma EWS-FLI1 Fusion Protein by Using Molecular Simulation[J].Acta Chimica Sinica,2010,68(13):1277-1284. |
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| Authors: | Cao Kai Huang Lu Lin Zhihua Shu Yong Han Zhimin Huang Shanhu Liao Xiang Wang Yuanqiang Peng Fangyi An Hong |
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| Institution: | (1 The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang 330006)
(2Jiangxi Maternal and Child Health Hospital, Nanchang 330006)
(3 Institute of Chemistry and Bioenginering, Chongqing University of Technology, Chongqing 400050)
(4 The First Affiliated Hospital of Chongqing University of Medical Sciences, Chongqing 400016) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ewing s sarcoma EWS-FLI1 fusion protein CTL epitope molecular dynamics simulation |
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