高通量测序技术在水环境微生物群落多样性中的应用 |
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引用本文: | 王绍祥,杨洲祥,孙真,刘燕,汪成伟,荆毓航.高通量测序技术在水环境微生物群落多样性中的应用[J].化学通报,2014(3). |
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作者姓名: | 王绍祥 杨洲祥 孙真 刘燕 汪成伟 荆毓航 |
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作者单位: | 上海城投原水有限公司;神华宁夏煤业集团有限责任公司太西炭基工业公司;复旦大学环境科学与工程系; |
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基金项目: | 上海城投原水有限公司“基于物联网的青草沙水库藻类监测预警平台研究”资助 |
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摘 要: | 微生物群落多样性的研究方法随着现代生物学技术经历了几代发展,基于形态学、生理学、分子生物学的传统研究方法在取得大量研究成果的同时,受对环境微生物群落多样性认识的限制,亟待获得一种能更加全面、准确、快速反映环境微生物群落结构的方法。本文首先回顾了传统研究方法,重点介绍了高通量测序技术,包括研究者所关注的测序仪分布、类型、原理、优势与制约,列举了多样性研究中的分析作图软件,最后以454的焦磷酸测序为例具体阐述了该方法在分析水环境微生物群落多样性中的应用。
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关 键 词: | 高通量测序技术 焦磷酸测序 生物信息分析 水体微生物群落多样性 |
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