| 肽β聚集的分子动力学模拟 |
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| 引用本文： | 吕明,赵熹,申兴桂,高雪峰.肽β聚集的分子动力学模拟[J].高等学校化学学报,2010,31(8). |
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| 作者姓名： | 吕明 赵熹 申兴桂 高雪峰 |
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| 作者单位： | 1. 吉林大学酶工程教育部重点实验室,长春,130023
2. 吉林大学理论化学计算国家重点实验室,长春,130023
3. 吉林大学生命科学学院,爱德蒙德·费舍尔信号传导实验室,长春,130012 |
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| 摘 要： | 选择一个可以形成淀粉样纤维的九肽作为研究对象,分别在酸性和碱性的环境下,运用分子动力学模拟的方法研究了这个九肽的β聚集结构,并且研究了它们的热稳定性.结果表明,在碱性环境下,九肽倾向于形成平行折叠结构,而在酸性环境下,九肽倾向于形成反平行折叠结构,与实验结果一致.此外,无论是构成哪种折叠,肽链都沿折叠的生长方向成左手螺旋状排布,但是相邻的肽链间的扭转角度不同,平行的扭转角小于反平行的扭转角,由此可以推断,平行的β折叠更容易形成β折叠片之间的堆积,因此可以在一定程度上解释在碱性环境下的九肽淀粉样纤维的直径大于在酸性环境下淀粉样纤维的直径这一实验结果.
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| 关 键 词： | 淀粉样纤维 分子动力学模拟 反应场 左手螺旋 |
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