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AutoDock软件在生物化学教学中的应用*——半柔性对接
引用本文:钟红梅,蔡开聪.AutoDock软件在生物化学教学中的应用*——半柔性对接[J].化学教育,2020,41(6):86-89.
作者姓名:钟红梅  蔡开聪
作者单位:1.福建师范大学化学与材料学院 福建省先进材料化工基础重点实验室 福建福州 350007;
2.福建省理论与计算化学重点实验室 福建厦门 361005;
3.特色生物化工材料福建省重点实验室 宁德师范学院 福建宁德 352100
基金项目:国家自然科学基金(21103021);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划;福建省教育厅(JAT170151);北京国家分子科学实验室(BNLMS20160101)。
摘    要:借助AutoDock软件开展蛋白质受体与配体的半柔性对接,探讨了其在生物化学教学中的应用,帮助学生对蛋白质受体与配体之间可能存在的相互作用有更为感性的认识,激发学生的学习兴趣,调动其学习积极性,从而达到提高教学质量的目的。

关 键 词:AutoDock软件  半柔性对接  A2A-T4L腺苷受体  生物化学  

Application of AutoDock Software in Teaching of Biochemistry: Semi-Flexible Docking
ZHONG Hong-Mei,CAI Kai-Cong.Application of AutoDock Software in Teaching of Biochemistry: Semi-Flexible Docking[J].Journal of Chemical Education,2020,41(6):86-89.
Authors:ZHONG Hong-Mei  CAI Kai-Cong
Institution:1.College of Chemistry and Materials Science, Fujian Provincial Key Laoratory of Andvanced Materials Oriented Chemical Engineering, Fujian Normal University, Fuzhou 350007, China;
2.Fujian Provincial Key Laboratory of Theoretical and Computational Chemistry, Xiamen 361005, China;
3.Fujian Province University Key Laboratory of Featured Materials in Biochemical Industry, Ningde Normal University, Ningde 352100, China
Abstract:The semi-flexible docking was performed for protein receptors and ligands by using AutoDock software, and its application in classroom teaching of biochemistry was discussed. It is helpful for the students’ understanding about the interactions between protein receptors and ligands, and inspire their interests and motivation in learning biochemistry, and for the improvement of teaching quality.
Keywords:AutoDock software  semi-flexible docking  A2A-T4L adenosine receptor  biochemistry
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