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| RNA碱基对的分子动力学模拟 | |
| 引用本文： | 张勇,王宇杰,张文炳.RNA碱基对的分子动力学模拟[J].武汉大学学报(理学版),2014(3). |
| 作者姓名： | 张勇 王宇杰 张文炳 |
| 作者单位： | 武汉大学物理科学与技术学院; |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31270761) |
| 摘 要： | RNA作为一种重要的生物大分子,其很多生物功能都与其结构有关.RNA碱基对的热力学性质和动力学性质是预测RNA结构的基础.本文采用全原子分子动力学方法模拟了RNA碱基对G—C在3种不同温度下的打开及闭合情况,统计分析了其打开和闭合几率.研究结果表明,随着温度的升高,碱基对G—C处于闭合状态的几率逐渐降低,处于打开状态的几率逐渐增加,而碱基对打开闭合状态的转换频率随着温度的升高而逐渐增加,并且形成碱基配对的3组原子间的氢键距离分布变宽. |
| 关 键 词： | RNA碱基对 分子动力学模拟 自由能 热力学 |
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