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抗原肽与MHC分子相互作用的QSAR模型研究
引用本文:宋哲,刘涛,刘伟,朱鸣华,王晓钢.抗原肽与MHC分子相互作用的QSAR模型研究[J].物理化学学报,2007,23(2):198-205.
作者姓名:宋哲  刘涛  刘伟  朱鸣华  王晓钢
作者单位:Department of Physics, College of Advanced Science and Technology, Dalian University of Technology, Dalian 116023, Liaoning Province, P. R. China
摘    要:分别采用氨基酸序列及氨基酸结构描述符方法定量研究了短肽-MHC(major histocompatibility complex)分子结合亲合力的定量构效关系(QSAR)模型, 用这两个模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测, 预测准确度分别达到66.8%和65.5%. 采用了去除“劣点”方法检验模型的鲁棒性, 结果证明两个模型都具有良好的鲁棒性. 通过改变两个模型的参数, 对氨基酸残基个数为8或10的CTL(cytotoxicy T lymphocyte)表位进行预测.

关 键 词:CTL表位  氨基酸结构描述符  定量构效关系  偏最小二乘法  
收稿时间:2006-07-12
修稿时间:2006-07-12

QSAR Model Study of Interaction between Peptides and MHC Molecules
SONG Zhe,LIU Tao,LIU Wei,ZHU Ming-Hua,WANG Xiao-Gang.QSAR Model Study of Interaction between Peptides and MHC Molecules[J].Acta Physico-Chimica Sinica,2007,23(2):198-205.
Authors:SONG Zhe  LIU Tao  LIU Wei  ZHU Ming-Hua  WANG Xiao-Gang
Institution:Department of Physics, College of Advanced Science and Technology, Dalian University of Technology, Dalian 116023, Liaoning Province, P. R. China
Abstract:
Keywords:
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