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1.
近年来,机器学习等人工智能技术被应用于蛋白质工程,其在蛋白质结构、功能预测、催化活性等研究中具有独特优势。在未知蛋白质结构的情况下,将蛋白质序列和功能特性与机器学习相结合,基于序列-活性关系(innovative sequence-activity relationship,ISAR)算法,将蛋白质氨基酸序列数字化,用快速傅里叶变换(fast four transform,FFT)进行预处理,再进行偏最小二乘回归建模,可在数据集较少情况下拟合得到最佳模型。通过机器学习对紫色球杆菌视紫红质(gloeobacter violaceus rhodopsin,GR)的突变体蛋白质氨基酸序列与光谱最大吸收波长进行建模,获得了最佳模型。用最佳索引LEVM760106建模得到的确定系数R2 为0.944,均方误差E为11.64。用小波变换进行的预处理,其R2 虽也约为0.944,但E大于11.64,不及FFT进行的预处理。方法较好地解决了蛋白质序列与功能特性之间的数学建模问题,在蛋白质工程中可为预测更优的突变体提供支持。 相似文献
5.
We employ a first-principles plane wave method with the
relativistic analytic pseudopotential of Hartwigsen, Goedecker and Hutter
(HGH) scheme in the frame of DFT to calculate
the equilibrium lattice parameters and the thermodynamic properties of
AlB2 compound with hcp structure. The obtained lattice parameters are in
good agreement with the available experimental data and those calculated by
others. Through the quasi-harmonic Debye model, obtained successfully are
the dependences of the
normalized lattice parameters a/a0 and c/c0 on pressure P, the normalized
primitive cell volume V/V0 on pressure P, the variation of the thermal
expansion α with pressure P and temperature T, as well as the Debye
temperature \ThetaD and the heat capacity CV on pressure P and
temperature T. 相似文献
6.
The acoustic and perceptive characteristics of discourse units, including clauses, simple sentences, compound sentences and paragraphs, were studied. The acoustic characteristics were based on the analysis of a speech corpus consisted of ten monologues. The Perceived Boundary Strength (PBS) of the monologues was labeled on a five-point scale by 25 participants. The main results are as follows: (1) There is a significant difference in the PBS of clauses (corresponding to intonational phrase), sentences (including simple sentences and compound sentences) and paragraphs. But the PBS of simple sentences and compound sentences is the same, and the pitch reset and pause are also not significantly different between these two kinds of boundaries. (2) The pitch-based cue used to distinguish clauses, sentences and paragraphs appears to be the difference between pre- and post-boundary syllables, but not simply the pitch value of either syllable alone. (3) Declination mainly occurs within intonational phrases, whereas there is no consistent global declination in sentences or in paragraphs. (4) Pauses are longer and more varied at the boundary of larger discourse units. Moreover, there is a significant positive correlation between pause duration and degree of pitch reset at clause boundaries, but not at sentence or paragraph boundaries. 相似文献
7.
A new type of THz waveguides, which employs a solid polyethylene rod as the core and polyethylene tubes in a periodic array of square lattice as the cladding, is proposed. Optical properties of this new THz waveguide, especially in dispersion, confinement loss and single mode property, are investigated in detail with the plane wave expansion method and the beam propagation method. Numerical results demonstrate that the new THz waveguide can reach not only low dispersion but also low confinement loss at single mode propagation. Therefore, the square lattice structure is a better candidate as THz waveguides than the triangular ones. 相似文献
8.
9.
对求解非线性方程方法的探索 总被引:2,自引:0,他引:2
BaiCL在2001年提出了双曲函数法,并把解设成具体的双曲函数,即sinhw和coshw的线性组合.本文把解设成是由2个函数f(ξ)和g(ξ)组成的线性组合,它们可以有多种取法,从而使方程更直接、更有效.借助数学软件Maple,用改进后的方法和吴文俊消元法,求解Bai C L文中的一个例子,获得了包含Bai文结果在内的更为丰富、精确的行波解. 相似文献
10.
计算了在不同对流混合参数下,8M⊙和1.3M⊙恒星由主序阶段到红巨星阶段的演化.得出以下主要结论:不同大小的混合参数导致了恒星在HR图中的演化轨迹、对流外壳的第2次向内延伸深度和回退程度、氢壳层源的温度和产能率,以及氦燃烧核的寿命等有显著差别,还注意到8M⊙恒星混合参数α≥2.2时会出现第2次蓝拐. 相似文献