含新型亲核体大环多胺锌(II)配合物对水解酶的模拟研究

本文探讨苯酚功能化的大环多胺配体6-(2'-羟基-3', 5'-二溴)-苄基-1, 4, 8, 11-四氮杂环十四烷(L)锌(II)配合物作为水解酶模拟物催化4-硝基苯酚醋酸酯(NA)水解的动力学。研究表明催化水解速率对NA及配合物浓度皆呈一级反应。水解速率遵循速率方程V=(kcat[Zn]+kOH[OH^-]+k0)[NA]。其二级反应速率常数kcat在一定范围内随着pH值的增加而增加, kcat的最大值(k)和kOH分别为0.12, 8.55mol^-^1.L.s^-^1。k0为NA的溶剂解速率常数, 其值为1.122×10^-^5s^-^1(298K, I=0.10,0.02mol.L^-^1tris缓冲溶液)。kcat值较以前报道的配合物更大, 催化活性更高。显示配位酚羟基可作为一种新型亲核体有效地催化NA的水解。配合物对NA水解的催化作用受酸碱平衡控制。根据实验结果提出了催化反应的机理。     

Hydroxamate类抑制剂与MMP-3的结合自由能的计算

用自由能微扰方法(FEP)计算了两种hydroxamate类的抑制剂和MMP-3的相对结合自由能。在计算中,对于催化区的锌离子与其共价结合的配体(包括抑制和组氨酸)采用了键合的模型,抑制剂和周围配体的部分电荷的计算采用两步静电势收敛方法。自由能计算采用了慢增长(Slowgrowth)和固定窗口增长(Fixedwidthwindowgrowth)两种方法,并且在每次计算中都采用了双向采样(Double-widesampling)的策略。两种方法计算得到的相对结合自由能都能和实验值很好的符合。同时从动力学模拟的得到的分子轨迹得到了抑制剂和受体之间相互作用模式,抑制剂的P1部分可以和受体的S1'口袋形成很强范德华和疏水相互作用,P1上的苯环可以和Tyr223上的苯环形成较好的π键堆积相互作用。     

二腈的区域和对映选择性生物水解反应: 腈水合酶与二腈分子 作用模式初探

在Rhodococcussp.AJ270细胞的催化作用下,内消旋的内式和外式双环[2.2.1]-庚烯-2,3-二腈和双环[2.2.2]-5-辛烯-2,3-二腈水解生成相应的二酸或酸酐,而外消旋的反式双环[2.2.1]-5-庚烯-2,3-二腈和双环[2.2.2]-5-辛烯-2,3-二腈则发生区域选择性和立体选择性的水解反应生成光活性的氰基酰胺和氰基羧酸。讨论了腈水合酶与二腈的作用模式。     

无机盐水合物对有机溶剂中酶促寡肽合成的影响

必需水的存在是酶在有机溶剂中保持活性的关键。本文研究了自由水初始水含量对有机溶剂中α－胰凝乳蛋白酶(α-chymotrypsin)和嗜热杆菌蛋白酶粗品(thermoase)催化合成寡肽的影响。用无机盐水合物Na2SO4·10H2O和Na2CO3·10H2O代替自由水重复了上述反应。实验表明,足量的无盐水合物能在有机溶剂中可逆地失去自射所带的结晶水,因而能代替自由水来提代酶所需的"必需水",并有效地控制有机溶剂中酶促反应体系的水活度(αw)值,从而有利于肽键的形成。