酪酸梭菌抗阿司匹林致小鼠胃溃 疡作用的初步研究

目的 观测酪酸梭菌是否对阿司匹林导致的胃溃疡具有预防效应,并对其机制进行初步探讨。方法 取30只健康 雄性ICR 小鼠,随机分成3 组,每组各10 只,即模型组、酪酸梭菌组、奥美拉唑组。酪酸梭菌组以6×108cfu/ 只的菌量,模型组和奥美拉唑组均予以相同体积的无菌培养基,灌胃4d 后再饥饿处理48h,然后以250mg/kg 剂量的阿司匹林灌胃造模,奥美拉唑组小鼠于造模前30min,腹腔注射奥美拉唑（13mg/kg）。造模4h 后,取胃组织分别测定SOD、CAT 活力、MDA 含量;进行常规HE 染色观察胃黏膜组织结构变化,PAS染色判断黏液量的变化,免疫组化法测定Bcl-2、Bax 表达水平。结果 模型组的SOD、CAT 活性明显降低,MDA 含量显著增加,而酪酸梭菌预处理后逆转了该趋势（P＜0.01）,与奥美拉唑组比较无统计学差异。HE染色观察,酪酸梭菌能减轻胃黏膜的病理损伤,与奥美拉唑组无统计学差异。PAS 结果提示酪酸梭菌能够增加黏液量。酪酸梭菌组的Bcl-2 表达较模型组显著增多,同时Bax 表达显著减少。结论 酪酸梭菌预处理通过抗氧化应激、增加胃黏液量、上调Bcl-2/Bax 表达比例,减轻阿司匹 林造成的胃溃疡损伤。     

一株嗜温高效产氢细菌Clostridium sp.08-1的分离鉴定与产氢特征

从10L连续搅拌式罐式反应器(CSTR)中分离得到1株嗜温高效产氢菌株08-1.根据菌株的形态特征和16S rDNA序列结果分析,初步鉴定菌株08-1属于Clostridium sp..同时还进一步研究了温度、pH值控制、底物浓度和种类对菌株08-1产氢的影响.结果表明.该菌株更适合利用蔗糖或成分复杂的生物质木薯粉以及废弃物厨余垃圾生长及产氢,最适产氢温度为40℃,产氢系统pH值控制在5.5时获得最大产氢量.在间歇发酵中,蔗糖浓度为20 g/L,控制温度40℃,pH值5.5,搅拌速度100 r/min时实现最大产氢速率为245 mL·(L·h)~(-1),最大产氢量达到3.06 mol.该菌株在生物制氢中具有潜在的应用价值.     

基于Logistic回归建模和马尔可夫链蒙特卡罗方法计算后验描述丁酸梭菌株对于给定辐照剂量区的应答趋势

利用马尔可夫链蒙特卡罗（Markov Chain Monte Carlo,MCMC）方法估计Logistic回归模型中的参数,就是要构造一个以参数的后验分布为其平稳分布的非周期不可约的马尔可夫链,然后用该平稳分布中抽出的样本点计算蒙特卡罗积分。上述理论方法可以解决实验样本数据由于存在定和约束和多重共线性、在进行经典的logistic回归建模时的困难问题。基于此方法,研究了丁酸梭菌株对于给定辐照区间剂量的应答趋势,用模型挖掘数据所隐含的内在信息并导出了Logistic回归模型参数的贝叶斯框架下的50%,90%,95%和99%的置信区间。结果表明,运用Logistic与马尔可夫链耦合模型在有关给定辐射剂量对于微生物作用效果问题的logistic回归建模中具有较大的科学性与很好的使用性,从而可以为辐照诱变处理微生物制定辐照剂量区提供理论支持和回归技术借鉴。Using the Markov Chain Monte-Carlo method to estimate the parameters in the Logistic regression model, we constructed a non-periodic irreducible Markov Chain with the posterior distribution of the parameters as stationary distribution, and then used the sample points extracted from the stationary distribution to calculate the Monte-Carlo integral. The above theoretical method can solve the difficult problem of classical logistic regression modeling because of the existence and limitation of the experimental sample data and the multicollinearity. In the classical regression setup with a continuous response, the predicted values can range over all real numbers. Therefore, a different modelling technique is needed. In this work, the results describe in detail a previously unknown lethality trend following 12C6+ heavy-ion irradiation of Clostridium tyrobutyricum. By Markov Chain Monte-Carlo can calculate the model fit for a randomly selected subset of the chain and calculate the predictive envelope of the model. The grey areas in the plot correspond to 50%, 90%, 95%, and 99% posterior regions. More importantly, although this study focused on the use of the method in heavy-ion irradiation of microbial, its results are broadly applicable.     

基于显微共聚焦拉曼光谱技术快速检测3种梭菌中肉毒梭菌

提出了一种基于显微共聚焦拉曼光谱技术的肉毒梭菌快速鉴别方法.利用共聚焦显微拉曼光谱技术(CRM)采集了肉毒梭菌、艰难梭菌和产气荚膜梭菌的拉曼光谱,比较了3种梭菌的平均拉曼光谱,采用基线校正、标准正态变换、Savitzky-Golay 5点平滑和最大最小值归一化预处理后,借助主成分分析(PCA)降维并提取特征变量,对样本...     

热纤梭菌中心代谢产物的归属及初步代谢组分析

热纤梭菌(Clostridium thermocellum)是一种能够高效利用木质纤维素的嗜热厌氧革兰氏阳性菌,是目前利用整合生物加工技术生产纤维素乙醇的最重要的候选菌株之一.代谢物组可以反映细胞和环境因子相互作用,是系统生物学的重要组成部分.目前,尚无使用核磁共振(NMR)方法对热纤梭菌的代谢组进行研究的报道,而对热纤梭菌代谢物的归属是进行代谢组研究的基础.该文通过1H NMR和2D NMR技术,对热纤梭菌的中心代谢产物进行了归属.在归属过程中,发现了若干特殊的重要代谢产物,包括纤维糊精、磷酸烯醇式丙酮酸、赤藓糖-4-磷酸等.这些代谢物对热纤梭菌的胞内代谢具有特殊的意义.利用已归属的代谢物,对热纤梭菌的野生型和乙醇耐受菌株进行初步的代谢组分析表明,热纤梭菌乙醇耐受性的获得,可能与纤维二糖主动合成纤维糊精途径、非氧化磷酸戊糖途径的增强及糖酵解路径的抑制密切相关.     

蜘蛛的启示

一次雨后,一只蜘蛛艰难地向墙上已经支离破碎的网爬去,由于墙壁潮湿,它爬到一定的高度,就会掉下来,它一次次地向上爬,一次次地掉下来……第一个人看到后,长叹了一口气,自言自语道:"我的一生不正像这只蜘蛛一样吗?忙忙碌碌却一无所得."于是,他日渐消沉.第二个人看到后,陷入了思考:"这只蜘蛛真愚蠢,为什么不从旁边     

毛细管离子电泳法定量监测丙酮丁醇梭菌发酵过程中产生的有机酸的浓度变化

建立了一种用于监测丙酮丁醇梭菌发酵过程中产生的3种有机酸(乳酸、乙酸、正丁酸)浓度变化的毛细管离子电泳方法。该方法以对甲氧基苯甲酸为电泳缓冲液,以十六烷基三甲基氯化铵(CTAC)为电渗流改性剂,采用间接紫外检测方式测定发酵过程中产生的有机酸。发酵液经过简单的离心处理后,上清液稀释后直接进样分析。考察了电泳操作条件对分离的影响,对实验条件进行了优化。优化后的分离条件为10 mmol/L对甲氧基苯甲酸（pH 5.8）、0.15 mmol/L CTAC。该方法测定乳酸、乙酸和正丁酸的定量限分别为1.22,0.38和0.58 mg/L;完成一次分析只需要5 min,并具有良好的重现性。该方法已成功地用于丙酮丁醇梭菌的代谢流量分析。     

应用气相色谱法鉴定艰难梭菌

应用国产气相色谱仪,选用不锈钢色谱柱,在色谱柱柱温１４０℃、检测室温度１９０℃下采用１５％改性聚乙二醇固定液（ＦＦＡＰ）,以氮气作载体,将从临床肿瘤病人粪便中分离的５株艰难梭菌（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）菌株与１株参考株的脂肪酸代谢产物气相色谱图进行了对比分析,发现分离株与参考株的色谱图非常相似：均出现乙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸、异己酸、丙酸、戊酸峰。其中乙酸、丁酸、异己酸峰较高;其次为异丁酸及异戊酸峰;而丙酸及戊酸峰则较低。     

丙丁梭菌萃取发酵产物的气相色谱分析

建立了3种溶剂中产物丙酮、乙醇、正丁醇的气相色谱分析方法。色谱条件为:DB-624色谱柱(30 m×0.32 mm,1.8μm)及FFAP色谱柱(30 m×0.32 mm,0.25μm),FID检测器,程序升温,氮气为载气。采用内标法定量,内标物为异丁醇,进样体积1μL。丙酮、乙醇、正丁醇的浓度与色谱峰面积线性相关,相关系数为0.997 43~0.999 97,测定结果的相对标准偏差为0.19%~2.01%(n=5),回收率为95.1%~101.2%。     

一种丁酸梭菌与鼠李糖乳杆菌的混合培养方法

采用混合培养的方法,通过CBS混合培养基,在37℃条件下,对丁酸梭菌与鼠李糖乳杆菌进行了混合培养.试验结果显示,两者在混合培养体系中表现出良好的互惠共生关系,混合培养生物量分别可达6.3×10~8,43.5×10~8 CFU/mL.较纯培养生物量分别增加80%和51.7%;混合培养液较纯培养对常见肠道致病菌具有更强的抑菌活性,抑菌活性大小依次为大肠杆菌,痢疾志贺氏菌,沙门氏菌.实验表明,该方法具有较好的可行性和实用性.