卵圆绒泡菌rDNA小亚基片段的克隆测序

粘菌(Myxomycetes)是真核生物中比较特殊的一个类群.但是有关其分子系统学却研究得较少,目前大多数研究仅集中在多头绒泡菌(Physarum polycephalum)等少数几个种上.本文选取卵圆绒泡菌(Physarum didermoides(Pers.)T.Macbr.)为实验材料,用引物SMNUR101和SMNUR108对其rDNA小亚基进行PCR扩增,PCR产物经Wizard(r)PCR扩增DNA纯化系统纯化后,克隆到大肠杆菌JM109中进行测序,测得的序列长度为1910bp(见图1).该序列的测得添补了我国绒泡菌分子生物学研究的空白,也为进一步研究粘菌的起源和演化提供了重要的分子生物学证据.     

利用生物发光技术检测微量焦磷酸

利用生物发光技术建立了一种高灵敏度的检测微量焦磷酸 ( PPi)的新方法。其原理是首先利用 ATP硫酰化酶 ( ATP sulfurylase)将焦磷酸 ( PPi)定量转化成ATP,然后利用虫荧光素酶 ( Luciferase)系统发光检测 ATP的量 ,从而确定样品中PPi的含量。本法快速、灵敏 ,线性范围为 1× 1 0 - 9～ 5× 1 0 - 7mol/ L。方法用于 PCR扩增样品中 PPi的检测 ,获得满意结果     

2D层状焦磷酸锰(Ⅱ)[NH4]2[Mn3(P2O7)2(H2O)2]的结构和磁性研究

A two-dimensional layered manganese(Ⅱ) pyrophosphate, [NH₄]₂[Mn₃(P₂O₇)₂(H₂O)₂] (1), has been synthesized hydrothermally. Its structure is determined by single-crystal X-ray diffraction analysis. Its structure is built up by MnO₆ octahedra and P₂O₇ units, with ammonium NH₄⁺ cations residing in the interlayer regions. The manganese pyrophosphate layer consists of infinite chains of cis and trans edge sharing MnO₆ octahedra linked by P₂O₇ units. Magnetic susceptibility measurements show that this compound exhibits ferrimagnetic-like ordering below 3.2 K. Further study shows that there are two possible superexchange pathways via the oxygen anions in Mn²⁺ ions. Owing to the different bridging modes of O^2-, the competition between ferromagnetic interactions and antiferromagnetic interactions in Mn²⁺ ions results in the ferrimagnetic behavior of 1.     

Aluminum Lon Removal from Monoaluminum Ovotransferrin by Pyrophosphate

The rates at which aluminum was removed from the N- and C-terminal monoaluminum ovotransferrins by pyrophosphate were evaluated by UV difference spectra in 0.01 mol/L Hepes, pH=7.4 and at 37℃. Pesudo first-order rate constants as a function of pyrophosphate concentration were measured. The results indicate that the pathways of aluminum removal are different. For the N-terminal binding site, aluminum removal follows simple saturation kinetics, while the removal of aluminum from the C-terminal binding site reverts to the combination of saturation and first-order kinetics. The saturation component is consistent with a rate-limiting conformational change in the protein as has been reported. We propose that the first-order kinetics mechanism is attributed to a pre-equilibrium process. The rate constants of saturation kinetics are accelerated from both terminals with the addition of 0.1 mol/L chloride to the monoaluminum ovotransferrin solutions, whereas the rates of the first-order kinetics are decreased for the C-terminal binding site. The effect of chloride ionic strength causes a continuing increase on kobs for the N- and C-terminal binding sites. Moreover, the kinetics behavior of the N-terminal is more easily affected by chloride than that of the C-terminal. In the experiment presumably the N-terminal site is apparently kinetically more labile than the C-terminal site.     

[Mn(H_2P_2O_7)_3]~(3-)引发淀粉与丙烯腈接枝聚合反应的动力学研究

以[Mn(H_2P_2O_7)_3]~(3-)为引发剂,研究了丙烯腈与玉米淀粉的接枝共聚反应。由实验结果求出了反应速率与引发剂浓度、单体浓度、淀粉浓度和反应温度的关系,推导并验证了接枝反应动力学模型,探讨了反应机理,求得了接枝反应活化能。     

谢晓亮院士研发出单细胞测序新技术

人类、草莓、蜜蜂、鸡和大鼠等许多生物体都已经进行过DNA测序。如果说测序个别物种具有挑战性,那么测序单个细胞的DNA无疑更难。为了获得足够的DNA进行测序,通常需要数以千计或甚至数以百万计的细胞。而找出哪种突变存在于哪种细胞     

拉曼光谱法定量分析焦磷酸根离子的含量

应用拉曼光谱技术研究了焦磷酸钾、硝酸钾、磷酸二氢钾、乙二胺四乙酸钠等十余种可溶性盐水溶液以及它们的混合物溶液的拉曼光谱特征,考察了共存组分对焦磷酸根拉曼光谱特征峰的影响;建立了基于拉曼光谱技术定量分析溶液中焦磷酸根离子含量的方法。结果表明,以硝酸钾为内标物,保持被测溶液pH 11,焦磷酸根离子拉曼光谱特征峰强度与硝酸根离子拉曼光谱特征峰强度之比值对焦磷酸根浓度呈良好的线性关系,所得线性回归方程为y=1.2110x+0.1515,相关系数R2=0.9996;已经研究过的十余种可溶性盐共存物几乎不干扰焦磷酸根离子的定量分析。     

肝素非还原端饱和结构的紫外吸收研究及在肝素寡糖测序中的应用

为了进一步探讨非还原端饱和结构的肝素寡糖在UV 232 nm的吸收情况, 制备了4种饱和结构的肝素二糖, 并用离子对反相液相色谱/离子阱飞行时间质谱(RPIP-LC/MS-IT-TOF)光电二极管阵列检测器分析了它们在UV 232 nm的吸收情况. 分析结果表明, 饱和结构的肝素二糖在UV 232 nm的检出限为9 μg(S/N=10), UV 232 nm/UV 206 nm约为不饱和结构肝素二糖UV 232 nm的7%~40%. 结果还表明, 肝素二糖UV 232 nm的吸收强度受亚硫酸基团(SO₃^2?)影响较大. 另外, 通过比较不饱和结构的肝素/硫酸类肝素(Hep/HS)标样二糖发现, 含N-未取代葡萄糖胺(GlcNH₃⁺)基团的二糖在UV 232 nm的吸收值较低. 最后, 通过简单的UV检测方法, 结合 HNO₂(pH=4.0)裂解法和RPIP-LC/MS-IT-TOF分析, 简化了含GlcNH₃⁺肝素六糖的测序方法. 本研究为以后用 HNO₂(pH=1.5)裂解法对混合组分N-硫酸化的肝素寡糖结构序列分析提供了可能.     

石墨烯纳米孔的制备及λ-DNA穿孔初步研究

纳米孔测序是有可能实现"$1,000 Genome"目标的技术之一.近年来,研究较多的纳米孔有蛋白质纳米孔和硅基材料的固态纳米孔.蛋白孔寿命比较短,而基于硅基底的固态纳米孔深度显著超过单链DNA相邻碱基的间距,所以,无法实现DNA的单个碱基的分辨.作者用聚焦离子束先制造氮化硅基底,并在该基底上铺设石墨烯,再用聚焦电子束刻蚀石墨烯,获得直径10 nm以下的纳米孔,初步分析了DNA穿越纳米孔时产生的电信号及穿孔噪音,向单层石墨烯纳米孔测序DNA迈出了一步.     

单细胞与空间转录组分析研究进展

单细胞的异质性在胚胎发育、神经系统发育、癌症病变等生物学过程中具有重要的研究意义。单细胞转录组测序利用测序技术解析细胞内转录本序列,为细胞异质性研究提供可靠、准确的研究手段及观测视野,为揭示生物发育规律、疾病发生发展机制等提供了重要的技术手段。该文围绕单细胞与空间组学分析,综述了近年来发展的各类单细胞转录组测序、单细胞多组学测序及空间转录组分析方法,分析了其优缺点。同时展望了单细胞与空间转录组分析领域的发展趋势,即开发低成本、全方位、高通量、高分辨的单细胞空间多组学分析方法以实现对单个细胞更为细致、全面及准确的描述和精准单细胞图谱构建。