白缘缺微卫星分子标记的筛选

用磁珠-生物素标记的微卫星探针（ACA）15与白缘缺（Leiobagrus marginatus）基因组酶切片段杂交，捕获含有微卫星序列的DNA片段，连接到T载体中，构建富集微卫星序列的小片段插入文库，再用γ^-32P标记的探针进行二次筛选，获得阳性克隆785个，对其中的140个克隆进行了测序，获得完整的微卫星序列132个．用引物设计软件Primer Premier5．0设计引物64对．对其中的20对引物进行了多态性检测，筛选到稳定扩增的标记13对，用此13对微卫星引物分析了缺属白缘缺（L．marginalus）、拟缘缺（L．marginatoides）（大、小各1种）、黑尾缺（L．nigricauda）共4个群体的遗传多样性，其中10对微卫星引物在种内或种间表现出多态性．     

白缘(鱼央)微卫星分子标记的筛选

用磁珠-生物素标记的微卫星探针(ACA)15与白缘缺(Leiobagrus marginatus)基因组酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库,再用γ-32P标记的探针进行二次筛选,获得阳性克隆785个,对其中的140个克隆进行了测序,获得完整的微卫星序列132个．用引物设计软件Primer Premier 5．0设计引物64对．对其中的20对引物进行了多态性检测,筛选到稳定扩增的标记13对,用此13对微卫星引物分析了缺属白缘缺(L．marginalus)、拟缘缺(L．marginatoides)(大、小各1种)、黑尾缺(L．nigricauda)共4个群体的遗传多样性,其中10对微卫星引物在种内或种间表现出多态性．     

虾夷马粪海胆微卫星标记制备及对3个养殖群体的遗传多样性分析

通过磁珠富集法分离获得了虾夷马粪海胆微卫星DNA序列160个.其中完美型108个(67.50%),非完美型33个(20.63%),复合型19个(11.88%),微卫星DNA序列最多重复次数达到107次.根据这些微卫星DNA序列的两翼序列,采用Primer 5软件设计出虾夷马粪海胆的微卫星引物,通过筛选,采用其中的12对微卫星DNA标记对大连凌水群体(DL)、大连獐子岛群体(DZ)、山东荣城群体(SR)3个虾夷马粪海胆养殖群体的遗传多样性进行分析,共获得73个等位基因,不同引物获得的等位基因数为1~11个,片段大小为84~362 bp.除SUX001位点外,其余位点的PIC值在0.264 0~0.670 5之间,3个群体的平均观测杂合度分别为0.4618(DL),0.437 5(SR)和0.434 0(DZ),平均期望杂合度分别为0.502 6(DL),0.507 9(SR)和0.449 4(DZ).Hardy-Weinberg平衡分析显示,73%的被检测位点显著偏离平衡,F-检验显示4个位点的Fst值低于0.05,表明群体间存在一定程度的分化.群体间遗传相似性系数、遗传距离及UPGMA聚类分析表明大连獐子岛群体(DZ)与大连凌水群体(DL)群体亲缘关系较近,二者与山东荣成群体(SR)亲缘关系较远.对深入了解我国虾夷马粪海胆养殖群体遗传结构特征及其种质资源状况具有重要意义.