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稀有(鱼句)鲫(Rare gudgeon)Sox基因的克隆及序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
根据人的SRY基因中HMG-box保守区设计引物,采用PCR技术在稀有(鱼句)鲫雌雄个体基因组DNA中分别扩增,发现3个大小分别为220、700和1 500 bp的片段,经过克隆和测序分析,从220 bp的片段中获得两个基因片段,证明为稀有(鱼句)鲫的Sox1和Sox21基因片段,无性别差异,其DNA序列与人及斑马鱼相应Sox基因相似性分别为Sox1:80.4%和97%;Sox21:77.3%和91%,其编码的氨基酸序列与人及斑马鱼相应SOX蛋白相似性分别为Sox1:96%和98%;Sox21:88%和100%,显示了其高度的保守性.此外,从GenBank、MEBL和DDBJ数据库获得了92个已克隆的物种SRY和Sox基因全长核苷酸编码序列及HMG保守区序列数据.通过对这些数据进行序列比对及聚类树的构建,分析了Sox基因家族成员的分类及分子进化模式,对稀有(鱼句)鲫的性别决定进行了探讨,为Sox基因的进化研究提供分子基础. 相似文献
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根据人的SRY基因中HMG-box保守区设计引物,采用PCR技术在稀有鮈鲫雌雄个体基因组DNA中分别扩增,发现3个大小分别为220、700和1500bp的片段,经过克隆和测序分析,从220bp的片段中获得两个基因片段,证明为稀有鮈鲫的Sox1和Sox21基因片段,无性别差异,其DNA序列与人及斑马鱼相应Sox基因相似性分别为Sox1:80.4%和97%;Sox21:77.3%和9l%,其编码的氨基酸序列与人及斑马鱼相应SOX蛋白相似性分别为Sox:96%和98%;Sox21:88%和100%,显示了其高度的保守性.此外,从GenBank、MEBL和DDBJ数据库获得了92个已克降的物种SRY和Sox基因全长核苷酸编码序列及HMG保守区序列数据.通过对这些数据进行序列比对及策类树的构建,分析了Sox基因家族成员的分类及分子进化模式,对稀有鮈鲫的性别决定进行了探讨,为Sox基因的进化研究提供分子基础. 相似文献
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由于在DOP—PCR实验过程中,通常的防污染措施和刘反应体系及条件的优化都无法完全消除阴性对照中出现的扩增产物,因此本研究对上述扩增产物进行了纯化、克隆和测序,发现该产物并非污染所致,而是由于引物自身的兼并性,序列相互配对而产生的引物多集体;并且还对与废扩增产物产量密切相关的引物浓度进行了优化探讨,实验结果表明2.2μmol/L是减少该产物产量的比较理想的引物浓度. 相似文献
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