蛋白质-蛋白质相互作用界面统计分析

以作者开发的从蛋白质结合部位推导出其界面所具有的疏水性质和氢键性质的计算程序PP_SITE为基础,利用蛋白质结构数据库(PDB),对蛋白质-蛋白质相互作用界面进行了统计分析.从PDB中挑出非冗余的链间相互作用对,计算出这个数据集中所有链间界面的疏水和氢键相互作用特征.对得到的界面特征进行统计分析,寻找能够明显聚类的界面特征.结果表明，界面大小、氢键和疏水相互作用在界面所占比例以及疏水相互作用的集中程度可以作为分类的依据.     

生物合理设计光系统Ⅱ抑制剂研究(Ⅴ)——取代苯甲酰胺基丙烯酸乙酯和新型嘧啶酮类化合物的合成及其Hill反应抑制活性

基于Dl蛋白结构模型,设计并合成了取代苯甲酰胺基丙烯酸乙酯及有关成环化合物嘧啶酮,通过X射线衍射确定了2-芳基-5-乙氧甲酰基-6-甲硫基-4-嘧啶酮的结构.生物活性测定结果表明,部分化合物显示出一定的Hill反应抑制活性.     

磷脂酶A2家族的功能性分类研究

采用“结合强度指纹图谱分析”方法, 通过对多重分子对接得到的作用强度数据进行聚类矩阵分析对蛋白质进行功能分类. 着重研究了磷脂酶A₂家族基于抑制剂作用强度的功能分类, 并且与基于序列的聚类结果进行比较, 成功地解决了序列比对方法不能处理的远源蛋白(cPLA₂)的分类问题.     

碳纳米管担载PtSn阳极催化剂对乙醇的电催化氧化性能研究

以多壁碳纳米管(MWNTs)为载体制备了担载型PtSn纳米催化剂,对其微观形貌和电催化性能进行了表征.透射电镜(TEM)及X射线衍射(XRD)测试结果表明,以MWNTs为载体提高了PtSn金属粒子的分散度,粒径分布范围在1.5-6.5nm之间,PtSn/MWNTs催化剂的平均粒径为3.6nm.循环伏安、计时电流及DEFC单池的实验结果表明,由于MWNTs具有独特的结构及丰富的表面基团和较高的导电率,PtSn/MWNTs催化剂对乙醇的催化氧化表现出比PtSn/XC-72更高的活性.     

黄铁矿在维持高放废物处置库近场还原性环境中的作用

研究了黄铁矿受60Coγ射线辐照后对地下水还原性环境的影响.辐照剂量率为200Gy·min-1,总吸收剂量为5×106Gy.通过分析辐照前后以及与地下水共同辐照后黄铁矿的结构和组成,发现60Co的γ射线可使地下水发生辐解反应,从而将黄铁矿氧化;但无论是直接辐照还是与地下水共同辐照,60Co的γ辐射均不改变黄铁矿的结构.黄铁矿可以消耗地下水辐解产生的氧化性产物,有利于维持处置库近场的还原性环境,提高处置库的安全性.     

p区金属基电催化还原二氧化碳制甲酸催化剂研究进展

以清洁可再生电能为驱动力,常温常压下将二氧化碳(CO₂)选择性还原转化生成高附加值化学品或燃料,是解决目前能源和环境问题、实现CO₂资源化利用、促进碳循环回归平衡的有效手段之一。由于生成不同产物的还原电位和反应历程不同,单位产物的生产成本各有差异。最近研究表明,HCOOH是所有电化学CO₂还原产物中最具有经济效益和实用价值的产物之一。本文从电催化还原CO₂制HCOOH生成机理出发,综述了p区金属(如Sn、Bi、In)基催化剂在电催化还原CO₂制HCOOH领域取得的重要研究进展,其中以典型催化剂为例分析了CO₂还原生成HCOOH活性提高策略如氧化物还原转化、形貌调控、掺杂和合金化等,重点探讨了活性位点种类、数量以及催化剂电子结构在关键中间体*CO₂^.-、*OCHO的形成和吸附中的作用,最后总结了目前该领域面临的挑战以及未来发展方向。     

计算有机化合物脂水分配系数的新方法

A new method is presented for the calculation of octanol/water partition coefficients. On the basis of summation of atomic contributions, our algorithm, namely; XLOGP, also incorporate correction factors into the calculation. Multivariate regression analysis was performed on a training database of 1831 organic compounds with diverse structures to give the final model. The correlation coefficients for the whole set fitting is 0.968 and the standard deviation is 0.37. The result shows that our model is accurate enough for logP estimation in QSAR studies. Compared to other similar approaches, our method gives better results and is more convenient to use.     

用氨基酸加和法计算多肽的脂水分配系数

Based on amino acid addition model, a set of hydrophobicity contributions of amino acids was obtained from the multivariate linear regression analysis of peptides' octanol/water partition coefficients. Multivariate regression was performed on a training set of 219 peptides including dipeptides to pentapeptides which we compose 21 natural amino acids. The correlation coefficients for the whole set fitting are 0. 978 and 0- 974, for log P and log D respectively. In addition, a new test method -evolution test-for regression analysis was discussed. The result of evolution test for amino acid addition model shows the advantage of this new test method.     

Effect of cationic surfactants on the interaction between sodium perfluorooctanoate and beta-lactoglobulin

The interaction between the fluorocarbon surfactant, sodium perfluorooctanoate (SPFO), and beta-lactoglobulin (BLG) was studied. In particular, the effects of cationic surfactants, such as alkyltriethylammonium bromide (C(n)NE, n=8, 10, 12), on SPFO-BLG interaction were examined. It was shown that the anionic fluorocarbon surfactant, SPFO, was a strong denaturant of BLG. The ability of SPFO to denature BLG could be weakened by the addition of C(n)NE. The effect of C(n)NE on SPFO-BLG interaction was related to the hydrocarbon chain length of C(n)NE, and also the molar ratio of the added C(n)NE to the SPFO in SPFO-BLG solutions ([C(n)NE]/[SPFO]). Our findings might provide a way to design surfactant systems that are less denaturing to proteins or tailor the ability of surfactant to denature proteins through the appropriate mixing with other surfactants.     

新型含哒嗪酮基双酰肼类化合物的3D-QSAR研究

用比较分子场分析方法对1-芳基-1，4-二氢-3-酰肼羰基-6-甲基-4-哒嗪酮类化合物进行了三维定量构效关系研究，发现影响其促进黄瓜子叶生根活性的主要为立体能.立体能与静电能之比为0.733:0.267.所得到的模型交叉验证值rCV2=0.643，相关系数r2=0.977, F=102.622, s=0.041，表明模型具有较好的预测能力.研究结果对3-酰肼羰基-4-哒嗪酮类化合物的改性或新类似物的合成具有指导意义.