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为了研究黄酮类醛糖还原酶抑制剂的抑制机理, 选择了31个黄酮类化合物作为训练集, 使用Catalyst软件包构建了此类抑制剂的药效团模型. 并专门针对黄酮类化合物定制了氢键给体和受体模型, 效果优于使用Catalyst内预定义的模型. 最终的药效团模型由两个氢键给体和一个氢键受体组成, 对训练集具有较好预测能力(Correl=0.9013). 此外, 使用InsightII/Affinity对6个黄酮类化合物进行了分子对接研究. 综合药效团模型和分子对接研究的结果, 发现黄酮类化合物的抑制活性主要源于黄酮骨架上的C4’或C3’位的羟基与醛糖还原酶活性口袋中的TYR48、VAL47、GLN49和C7位的羟基与HIS110, TRP111所形成的两组氢键. 相似文献
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采用Discovery Studio2．0中的药效团模型生成方法,产生了基于化学特征的ACE抑制肽的药效团模型．所选择的认为最好的药效团模型（Hypo1）含有5个化学特征（1个阴离子中心、1个氢键受体、1个氢键给体、2个疏水中心）．我们先前采用实验的方法,从蚕蛹蛋白中获得具有ACE抑制活性的六肽分子,本文结合产生的ACE抑制肽药效团模型和分子对接研究,对该六肽分子进行结构优化,以识别六肽中对ACE抑制活性起关键作用的结构部分．结果显示,药效团模型的方法可有效用于ACE抑制肽的结构优化． 相似文献
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