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喜树碱类抗肿瘤药物作用模式的柔性分子对接研究 总被引:3,自引:0,他引:3
研究采用柔性分子对接技术,将15个喜树碱类化合物对接到拓扑异构酶I (Topo I)-DNA切割复合物中,从原子水平和分子力场角度阐明了喜树碱类抗肿瘤药 物与DNA,Topo I的相互作用机制。研究发现,喜树碱分子插入Topp I-DNA复合物 的切割位点,并与Asn722,Asp533,Lys532和Lys720形成氢键作用网络。定量构效 关系研究进一步表明喜树碱分子可以与Topo I-DNA切割复合物形成电荷迁移作用。 该对接模型系统解释了喜树碱类化合物的构效关系、定点突变等诸多实验事实,为 下一步设计、合成新型高效的喜树碱类衍生物打下了坚实基础。 相似文献
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苯并呋喃类N-肉豆蔻酰基转移酶抑制剂的三维定量构效关系研究 总被引:4,自引:0,他引:4
摘要采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA), 系统地研究了40个苯并呋喃类N-肉豆蔻酰基转移酶(NMT)抑制剂的三维定量构效关系. 在CoMFA研究中, 考察了网格点步长对模型统计结果的影响. 在CoMSIA研究中, 研究了各种分子场组合、 网格点步长和衰减因子对模型统计结果的影响, 发现立体场、 静电场、 疏水场和氢键受体场的组合可得到最佳模型. 所建立的CoMFA和CoMSIA模型的交叉相关系数q2值分别为0.759和0.730, 均具有较强的预测能力. 利用CoMFA和CoMSIA模型的三维等值线图直观地解释了化合物的构效关系, 阐明了化合物结构中苯并呋喃环上各位置取代基对抑酶活性的影响, 为进一步结构优化提供了重要依据. 相似文献
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3′-O-(甲硫甲基)缩醛的脱氧核苷(1)与N-碘代丁二酰亚胺(NIS)和二苯基次膦酸反应得到相应的3′-O-(二苯膦酰氧)甲基缩醛(2)。在三甲基硅三氟甲磺酸酯(TMSOTf)的条件下,后与3′-位保护的脱氧核苷(5)缩合,得到(3′→5′)亚甲基缩醛连接的二聚体d[(B1-m-B2)](m=次甲基)(6)。同样的,2(B=T或B=C)与3′-位保护的二聚体9(T-m-T或C-m-T)缩合,可得到相应的三聚体10(T-m-T-m-T,C-m-T-m-T和T-m-C-m-T)。 相似文献
4.
苯并卟啉羟基和醚类衍生物的简便合成 总被引:2,自引:0,他引:2
以原卟啉IX二甲酯(1)为起始原料,简便地合成了四种位置异构体苯并卟啉羟基及醚类衍生物:3-甲氧乙基苯并卟啉衍生物16,3-羟乙基苯并卟啉衍生物17,8-甲氧乙基苯并卟啉衍生物20和8-羟乙基苯并卟啉衍生物21。 相似文献
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(3'→5')亚甲基缩醛连接的二聚和三聚体脱氧核苷的另法合成 总被引:1,自引:0,他引:1
3'-O-(甲硫甲基)缩醛的脱氧核苷(1)与N-碘代丁二酰亚胺(MS)和二苯基次膦酸反应得到相应的3'-O-(二苯膦酰氧)甲基缩醛(2).在三甲基硅三氟甲磺酸酯(TMSOTf)的条件下,后者与3'-位保护的脱氧核苷(5)缩合,得到(3'→5')甲缩醛连接的二聚体d[(B1-m-B2)](m=次甲基)(6).同样的,2(B=T或B=C)与3'-位保护的二聚体9(T-M-T或C-m-T)缩合,可得到相应的三聚体10(T-m-T-m-T,C-m-T-T和Y-m-C-m-T). 相似文献
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