DNA编码序列的关联特性

用ＤＮＡ行走方法和信息剩余度方法研究了核酸编码序列中的碱基关联，指出了这种关联的短程性．讨论了碱基组成漂变导致的表现关联效应和各种关联模的涨落限．对最近的有关文献作了评述．     

按大肠杆菌高表达序列设计的入干扰素α—2b基因的化学合成和克隆

根据大肠杆菌高表达序列重新设计了人干扰素α—2b基因编码区的核苷酸序列，应用化学合成的方法合成了多个互补DNA片段，经互补片段分别退火和连接后，将完整编码区分两段分别克隆于pUC19质粒中，进行DNA序列分析，分别选取序列完全正确的两种克隆片段进行重组，获得了与设计序列完全一致的含有完整编码区的人干扰素α—2b基因。     

蛋白质的二级结构序列和结构型

从蛋白质的二级结构序列出发 ,提出了冗余的概念 ,定义了冗余数量和冗余长度 ,给出了不同结构型蛋白的冗余数量和长度的分布特性 .统计结果表明 α类蛋白中 30 %、β类蛋白中84 %、α/β类蛋白中 95 %的序列不同程度的存在冗余 ,冗余数量和冗余长度主要分布在 1～ 3的范围 .以主二级结构序列三联体为参数 ,利用信息聚类方法对 α类、β类、α/ β类、α β类的6 0 0个蛋白进行了聚类 ,结果表明 ,对冗余较少的α类蛋白 85 %以上能够较好地聚类在一枝中 ,但对于冗余较多的其它类蛋白不能分在一个大支中 ,大部分可以分散在多个小支中 .以主二级结构序列三联体为参数 ,利用 Mahalanobis距离方法对上述四种结构型进行预测 ,预测的总体准确率为 81 .1 % .聚类结果和利用 Mahalanobis距离分类结果充分展示了蛋白质二级结构序列对结构型的特殊作用 ,但由于冗余的影响使得二级结构序列的信息并未充分显示出来 .说明从蛋白质二级结构序列出发预测结构型和构建蛋白质框架结构是合理的选择     

λ噬菌体操纵基因和调控蛋白相互作用网络及溶原态/裂解态转变特性的动力学研究

根据大肠杆菌中λ噬菌体操纵基因与调控蛋白相互作用特点,提出操纵基因与调控蛋白相互作用模型.利用动力学方法,得到了两种调控蛋白浓度随时间变化的关系和在一定的时间范围内两种调控蛋白之间的关系,并且得到调控系统的稳态性质,进而分析调控系统溶原态/裂解态的转变特性.     

线粒体密码表的进化关系

提出一个理论模型,由此推导出标准密码表与10个物种线粒体非标准密码表之间的进化关系,得到这些表的进化关系和真核总界中物种的三界分类正相吻合,同时发现氨基酸与终止密码间的无义突变和其逆过程是重建进化树的关键因素.     

信息生物学--关于编码信息量的两个假设

提出并论证了关于编码信息量的两个规律.第一,基因组的编码信息量在进化中随时间增加.第二,基因序列的碱基频数分布决定于多样性的稳定化.此二规律和其他规律一起构成了信息生物学的理论基础.不同于生物信息学,信息生物学将以生命信息的遗传,传输,调节和表达的基本规律为研究中心.     

核子与氘核散射中的极化

利用转动、反射及时间反演的不变性,求得核子与氘核散射中极化的一般公式,并且把所得的结果通过散射相移表示出来。     

DNA序列的核苷酸统计关联

探索核苷酸统汁关联的规律性是遗传语言研究的基础。本文评述了这个领域的工作,着重讨论了核苷关联的短程为主性,DNA序列的信息参数分析,以及关联的进化相关性。文中还强调了核苷关联的生物学意义及这一研究的可能生物学应用,其中包括:构建进化树,预测蛋白质二级结构,寻求碱基关联偏好模的规律性,导出编码序列和非编码序列的遗传语言差别,通过关联谱和偏好模发现阅读框架,研究核苷关联和基因表达的关系(表达增强网络),研究长周期关联及功率谱的低频行为等。     

λ噬菌体溶源/裂解转换调控与定态熵

被λ噬菌体感染的大肠杆菌是研究生物基因调控网络的重要模板之一. 根据该调控系统操纵子与调控蛋白相互作用特点, 利用热力学配分函数描述调控蛋白与操纵子的结合概率, 在给出该调控系统的动力学分岔的基础上, 计算系统各定态的热力学熵. 结果显示, 溶源态和裂解态较鞍点和分岔点具有更低的熵值, 且溶源态的熵最低, 说明处于溶源态的系统具有更高的生物序.