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基于网络药理学及动物实验研究苗药阔叶十大功劳抗炎的有效成分及作用机制。用二甲苯、角叉菜胶分别制作小鼠及大鼠的炎症模型,并灌胃阔叶十大功劳(小鼠剂量为1.950 mg/kg;大鼠剂量为1.350 mg/kg)。通过TCMSP、SymMap、SwisstargetPrediction、SEA、STICH等数据库,以口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18获取阔叶十大功劳的活性成分及其相应靶点;通过GeneCards、DisGeNET、TTD、DrugBank、OMIM等数据库获取炎症相关靶点;通过Venny 2.1.0获取疾病和药物的交集靶点,通过Cytoscape的MCODE、CytoHubba插件得到10个关键靶点,并构建药物-成分-靶点网络图;对10个Hub gene进行KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)和GO (gene ontology)富集分析以及分子对接。动物实验结果表明,阔叶十大功劳能够减轻小鼠和大鼠的炎症症状。网络药理学分析获得28个阔叶十大功劳活性化合物,753个药物作用靶点,1 025个炎症靶点,阔叶十大功劳-炎...  相似文献   
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为探讨葛花解酲方(GHJCF)通过调控自噬干预肝细胞癌进展的作用机制,根据GEO数据库中GSE45267和GSE87630肝癌数据集,将自噬相关的222个基因与GHJCF靶点和数据集的差异表达基因用韦恩图取交集得出关键基因,进行靶点预测并建立蛋白质-蛋白质相互作用网络图;随后利用生物信息学的方法进行临床因素相关分析和生存预后分析。最后使用分子对接进而筛选出GHJCF通过调控自噬干预肝细胞癌进展的作用机制,获得4个GHJCF介导自噬干预肝细胞癌的靶点。与对照组(癌旁组织)相比,肝癌组中CCL2、NFE2L2、FAS和BIRC5表达均具有显著差异;THPA数据库病理切片验证NFE2L2、CCL2、BIRC5等蛋白在正常组中低表达,在癌症组织中高表达;CCL2和BIRC5与性别、癌症分期、淋巴结转移具有显著相关性;5年生存预后分析显示两者都有预后价值;最后分子对接显示BIRC5蛋白能与GHJCF中的染料木素、槲皮素、葛根素和木犀草素成分结合且对接分数较高,CCL2能与槲皮素成分结合且对接分数较高。通过以上生物信息学分析,结合临床数据相关性,GHJCF可能通过染料木素、槲皮素、葛根素和木犀草素...  相似文献   
3.
目的:旨在探讨熊胆逐瘀片(XDZYP)治疗糖尿病视网膜病变(Diabetic Retinopathy, DR)的物质基础及作用机制。方法:通过Symmap、Swiss Target Prediction检索XDZYP的成分及靶点;通过CTD及DisGeNET检索DR靶点;两者靶点取交集,构建中药-成分-靶点网络;蛋白-蛋白互作聚焦20个枢纽靶点;将枢纽靶点进行GO、KEGG富集分析以及转录因子预测及分子对接。结果:获得XDZYP活性成分105个,靶点112个,其中20个枢纽靶点主要参与血管内皮生长因子产生,调控TNF、AGE-RAGE、细胞凋亡通路,还可被CSRNP1、NFKB2等转录因子调控,其中靶向结合化合物的有:IL4-水杨酸,STAT3/IL6-杨梅酮,CHUK/PARA-槲皮素,TGFB1-丹参素,MYC-丹参酮IIA,TNF-胆酸等。结论:XDZYP主要通过槲皮素、杨梅酮、水杨酸、丹参素等靶向IL4、IL6、PPARA、CHUK等参与TNF、AGE-RAGE、细胞凋亡通路而治疗DR。  相似文献   
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