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1.
为了说明V82A和L90M变异对蛋白酶(PR)和茚地那韦(IDV)复合物的影响,进行了5.5ns的MD模拟.用MM-PBSA方法计算了体系的结合自由能,计算和实验结果一致.分解自由能为不同能量项说明,这两个变异引起熵的贡献变化大于焓的贡献变化.分解自由能到每个残基说明Wild,V82A和L90M具有相似的结合模式,结合能的贡献主要来源于A28/A28',I50/I50'和I84/I84'这六个残基组,详细分析了Wild和IDV的结合模式,对比分析了V82A和L90M变异引起结合模式的细小变化.V82A变异引起结合模式的变化是由于变异后位阻减小导致的.L90M变异引起D25和L90间的作用增强并引起结合模式的细小变化.研究结果有助于更好地理解变异对抑制剂和HIV-1PR结合模式的影响,并可以用来帮助设计更高效的PR抑制剂.  相似文献   
2.
扈国栋  张少龙  张庆刚 《化学学报》2009,67(9):1019-1025
FKBP12 (FK506-binding protein-12)是一种具有神经保护和促神经再生作用的蛋白. 采用分子动力学模拟取样, 运用MM-GBSA方法计算了FKBP12和3个抑制剂(GPI-1046, 308和107)的绝对结合自由能, GPI-1046的结合能最小, 308小于107的结合能. 通过能量分解的方法考察了FKBP12蛋白的主要残基与抑制剂之间的相互作用和识别, 计算结果表明: 3个抑制剂具有相似的结合模式, Ile56和Tyr82主要表现为氢键作用, Tyr26, Phe46, Val55, Ile56, Trp59, Tyr82, Tyr87和Phe99形成疏水作用区. 计算结果和实验结果吻合.  相似文献   
3.
4.
太极拳运动可引起多种膝关节损伤,这些损伤的原因主要与技术动作不规范、股四头肌力量不足、重心过低、疲劳过度有关.笔者分析了这些原因,以期为更好地发挥太极拳的健身作用、防止不必要的膝关节损伤提供一些参考.  相似文献   
5.
本文分别从盾构施工地面沉降监测的内容、监测方法、沉降监测数据处理方法以及沉降规律研究几个方面探讨了盾构法施工隧道工程地面沉降控制技术,并以天津市区至滨海新区快速轨道交通工程中山门区间为例,分别从以上几个方面进行了研究,在横向沉降规律上对peck公式的两个重要参数v和k进行了修正(v从0.5%-2.0%改为1.0%-1.5%,k有0.4-0.6改为0.5-0.6),确定了纵向沉降指数曲线函数的参数范围(A-15--20 mm,B0.03-0.09,S0-3-7 mm,x00-5 m),这些丰富盾构法施工地面沉降控制技术研究。  相似文献   
6.
在园林绿化树种的选择中首先要以绿化树种的生物特点为依据,按照当地气候特点做到适地适树,同时还要重视先锋树种的作用,以便使绿化速见成效,迅速郁闭成林。青海东部地区和甘肃西部地区都处于黄土高原向青藏高原过渡地带,立地条件及气候条件相差不大且近几年小城镇建设飞速发展,为了解决园林树种稀少,品种单调问题,我们根据近几年的实践经验,对园林树种的资源选择、驯化等问题做了一些分析和总结。  相似文献   
7.
论新闻真实     
新闻真实既有重要意义,又要面临一些尴尬。新闻真实就是要做到对社会生活中新近发生的事实尽量准确、全面、辩证地如实描绘。新闻真实受到制约,尤其是来自各方面的控制形成的新闻选择。于是我们相应提出一些对策。  相似文献   
8.
The reaction O(^3P)+HCl (v=2; j= 1,6,9) → OH+Cl is theoretically studied with a quasi-classical trajectory method (QCT) on the benchmark potential energy surface of the ground 3A'' state [J. Chem. Phys. 119(2003)9550]. The QCT-calculated state-resolved rotational distributions are in good agreement with the experimental results. The rotational polarization of the product OH molecule becomes weaker as the initial HCl rotation is excited. The calculated results can be explained from the large mass factor cos2 β of the title reaction, the van der Waals well in the potential energy surface and the secondary encounters in the exit channel.  相似文献   
9.
孕酮在确立和维持妊娠中起到了关键的作用. 为了研究孕酮和孕酮受体蛋白的结合模式,进行了3.5纳秒的分子动力学模拟,用 MM-PBSA\GBSA方法计算了结合自由能. 自由能分解和丙氨酸扫描两种方法说明,残基 Leu718, Met756, Met759, Phe778 和 Tyr890 对于结合抑制剂作用明显,这些残基的主要作用能是范德瓦尔斯作用能. 这一研究结果可以指导孕酮受体蛋白抑制剂的优化  相似文献   
10.
针对传统的可加故障率模型(AHM)在描述设备状态对故障率的影响时存在缺陷,提出采用健康指数作为表征设备状态的变量,建立起以役龄和健康指数作为变量的AHM模型,基于该模型的构建原理提出模型解法,共三步:首先,求解基准故障率函数时,运用基于LS-SVM的EMD改进算法获取故障率演变曲线,用遗传算法优化该曲线;然后,求解协变量函数时,运用了灰色理论的NGDM模型;最后,对基准故障率函数和协变量函数进行联合优化。通过仿真数据验证,该方法的拟合误差小于2%,预测误差小于3%。结合真实案例探讨了模型适用性的初步检验方法,最终对模型的使用方法进行了论述。  相似文献   
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