肝细胞癌中铜死亡标志物的筛选及化合物的预测

通过文献查阅铜死亡相关基因,使用STRING数据库对铜死亡相关基因产物进行PPI分析;使用R语言、Kaplan-Meier方法、THPA以及TIMER等数据库进行铜死亡相关基因与HCC相关的差异表达分析、ROC分析、临床的相关性分析、免疫浸润,最后将得到的铜死亡相关基因进行药物筛选和分子对接.结果显示,共筛选出4个与肝癌相关性较强的铜死亡相关基因,即DLAT、CDKN2A、GLS和MTF1,它们主要参与TCA循环、铂类耐药性、癌症中的碳代谢、丙酮酸代谢、糖酵解/糖异生等.4个基因与患者5年生存率相关性较大,与性别、淋巴结转移、肿瘤分期和免疫细胞密切相关,最后筛选出阿霉素、表没食子素没食子酸酯、曲格列酮、熊去氧胆酸等与上述蛋白结合能力较高的活性化合物.     

阔叶十大功劳抗炎作用机制的实验研究及网络药理学分析

基于网络药理学及动物实验研究苗药阔叶十大功劳抗炎的有效成分及作用机制。用二甲苯、角叉菜胶分别制作小鼠及大鼠的炎症模型,并灌胃阔叶十大功劳(小鼠剂量为1.950 mg/kg;大鼠剂量为1.350 mg/kg)。通过TCMSP、SymMap、SwisstargetPrediction、SEA、STICH等数据库,以口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18获取阔叶十大功劳的活性成分及其相应靶点;通过GeneCards、DisGeNET、TTD、DrugBank、OMIM等数据库获取炎症相关靶点;通过Venny 2.1.0获取疾病和药物的交集靶点,通过Cytoscape的MCODE、CytoHubba插件得到10个关键靶点,并构建药物-成分-靶点网络图;对10个Hub gene进行KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)和GO (gene ontology)富集分析以及分子对接。动物实验结果表明,阔叶十大功劳能够减轻小鼠和大鼠的炎症症状。网络药理学分析获得28个阔叶十大功劳活性化合物,753个药物作用靶点,1 025个炎症靶点,阔叶十大功劳-炎...