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It is well known that porphyrin derivatives play a key role in the primary process of photo-synthesis[1], in which porphyrins directly absorb the sunlight or indirectly acquire excitation en-ergy from light-harvesting antenna system to reach their excited state, and then donate electrons to quinone acceptors to yield a series of charge-separated species. In general, only first singlet ex-cited state of porphyrins is involved in energy transfer process[2]. However, highly excited state (S2 stat… 相似文献
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基于药效团模型的DHODH抑制剂构效关系研究 总被引:1,自引:0,他引:1
利用药效团模型研究二氢乳清酸脱氢酶(Dihydroorotate dehydrogenase,DHODH)抑制剂的构效关系,为DHODH抑制剂的虚拟筛选提供新的方法.以31个具有DHODH抑制活性的化合物为训练集化合物,半数抑制浓度(IC50)范围为7~63000 nmol/L,利用Catalyst/HypoGen算法构建DHODH抑制剂药效团模型,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型.利用基于CatScramble的交叉验证方法及评价模型对已知活性化合物的活性预测能力,确定较优药效团模型.模型包含1个氢键受体、3个疏水中心,表征了受体配体相互作用时可能发生的氢键相互作用、疏水相互作用和π-π相互作用,4个药效特征在三维空间的排列概括了DHODH抑制剂产生活性的结构特点.所得较优模型对训练集化合物及测试集化合物的计算活性值与实验活性值的相关系数分别为0.8405和0.8788.利用药效团模型对来源于微生物的系列化合物进行虚拟筛选,筛选出59个预测活性较好的化合物,可作为进一步药物研发的候选化合物. 相似文献
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高场强核磁共振下测量水的自旋晶格弛豫时间 总被引:1,自引:0,他引:1
在反转恢复脉冲序列中增加双极性梯度场脉冲以压制辐射阻尼效应,从而使之能够在高场强核磁共振波谱仪(Bruker AV600)中较为准确测量水的自旋-晶格时间.这一方法应用于商品化成像对比剂Gd-DTPA的弛豫率测试,得到的结果和文献相似,证实了该方法的可靠性.进一步应用于新合成成像对比剂TEMDP-EMFs性能的评价. 相似文献
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葛根素衍生物的合成、表征及衍生化反应机理 总被引:4,自引:0,他引:4
合成了葛根素的7,4'-二丙基(Ⅰ), 7-单丙基(Ⅱ)和4'-单丙基(Ⅲ)三种取代衍生物. 其中7-丙基葛根素Ⅱ属于新型取代衍生物; 变温1H NMR和理论计算结果表明, 在300 K时, 葛根素和4'-丙基葛根素(Ⅲ)以单一构型存在; 而7,4'-二丙基葛根素(Ⅰ)和7-丙基葛根素(Ⅱ)则存在两种核磁可分辨的旋转异构体, 当温度升至330 K时, 两种异构体可以相互转化; 通过对比分析葛根素及其衍生物脱质子产物的紫外可见吸收光谱并结合理论计算, 确定了A环上7位酚羟基比B环上4'位酚羟基先脱去质子, 并由此进一步阐明了葛根素衍生化反应机理以及在抗氧化作用中可能的活性位点和结构活性关系. 相似文献
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近年来,随着计算化学理论的不断突破,以及计算硬件性能的大幅提高,基于第一性原理针对有机分子开展1H和13C核磁共振化学位移的精确计算技术也取得了很大进展,部分方法已经逐步用于较大分子及较复杂分子体系的准确预测.本文建立了一个基于密度泛函理论的高精度有机分子化学位移在线计算系统平台,能够在线交互式完成分子量小于800的分子的化学位移计算服务.该系统平台工具能加快构建分子结构与核磁共振谱图的映射关系过程,为有机分子核磁共振谱图的高效指认,以及结构精确解析提供一个新的有力支撑. 相似文献
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纯位移核磁共振氢谱及其应用 总被引:1,自引:0,他引:1
J耦合引起的核磁共振(NMR)信号多重裂分的数目和耦合常数反映了磁性原子核之间的化学键数目和空间位置信息,是研究分子结构的重要依据之一.但是当分子中磁性原子核数目增加时,NMR谱图特别是一维核磁共振氢谱(1D ~1H NMR)中,J耦合所致的多重裂分造成谱图重叠,严重干扰结构指认和定量分析.利用纯位移(亦称宽带同核去耦)~1H NMR谱图可以消除J耦合效应(即将相邻质子间耦合所引起的多重裂分融合成一个单峰),得到与去耦碳谱相似的、只含化学位移信息的谱图.该文首先介绍了三种最受关注的获取纯位移核磁共振氢谱技术——BIRD、ZS和PSYCHE的基本原理,随后综述了纯位移~1H NMR谱图的典型应用. 相似文献
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应用荧光光谱法研究三种原小檗碱类生物碱: 盐酸小檗碱(Berberine hydrochloride)、药根碱(Jatrorrhizine)和盐酸巴马汀(Palmatine hydrochloride)与抗凋亡蛋白Bcl-2之间的相互作用, 探讨了这三种生物碱对Bcl-2蛋白的荧光淬灭机理, 分别测定其结合常数和结合位点数. 实验结果表明, 盐酸小檗碱、药根碱和盐酸巴马汀等三种原小檗碱类生物碱都能够使Bcl-2蛋白的内源性荧光发生淬灭, 其荧光淬灭过程是静态淬灭过程. 通过比较三种生物碱与Bcl-2蛋白的相互作用, 发现随着分子柔性增强, 其与Bcl-2蛋白的结合能力增强. 因此, 增强生物碱的分子柔性有可能增强其靶向Bcl-2蛋白的能力. 相似文献