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采用半经验量子化学计算方法AM1,计算了超声场作用下铝酸钠溶液中可能存在的各类铝酸根离子、自由基以及它们之间发生反应的可能产物的热力学生成焓和前线轨道数据.根据计算结果,分析了各种可能反应的热力学趋势;并在此基础上对热力学趋势较大的反应运用前线轨道理论进行了成键可能性分析.结果表明,超声场作用下产生的自由基促进了铝酸钠溶液中Al(Ⅲ)配位数的增加并形成生长基元单体Al(OH)4-(H2O)2,同时自由基并不迅速被消耗,因此,超声场可以促进工业上铝酸钠溶液的分解过程. 相似文献
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原子电荷在深入理解和模拟蛋白质的化学行为中发挥了重要的作用。通过校正电负性均衡方法(EEM)可快速计算大分子中原子电荷的分布情况。为进一步提高电负性均衡方法的准确性,本文根据Bader提出的分子区域片段中原子电荷高度转移理论,提出了一种校正电负性均衡理论的新方法,专门用于快速、准确计算生物大分子多肽或蛋白质中分子中原子电荷(AIM)。在EEM参数优化过程中,本方法不仅包括了不同原子间的连接性和价键的杂化属性,还考虑了分子片段或基团的区域化学环境因素对校正的影响。本研究对变量优化方法进行了深入讨论,微分进化算法被证明对目标函数有较好地表现。本方法计算的AIM电荷,与密度泛函理论的计算结果进行了比较。结果表明,与原来的EEM模型相比较,本方法计算的AIM电荷的精确度得到了大幅提高,为具有重复分子片段或基团的生物大分子体系(如多肽或蛋白质等)的原子电荷的快速计算提供了一种更为准确的方法,同时也为EEM的校正提供了一种新的思路。 相似文献
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采用密度泛函理论, 将基于能量的分子片方法(GEBF)应用于气相中优化B型脱氧核糖核酸(碱基对数目N=2, 5, 10)双螺旋构型的结构. 通过比较M06-2X泛函和其他方法(B3LYP、B3LYP-vdW和TPSS泛函)的结果, 发现不考虑碱基之间的π-π堆积作用将会导致碱基之间的纵向距离拉长. 随着体系双螺旋链长的增加, 没有考虑碱基堆积作用而导致的相邻碱基纵向距离拉长的程度快速衰减. 计算表明, 气相中B-DNA双螺旋结构的稳定性来源于其作用力(主要是氢键和π-π堆积作用)的协同性, 对不多于10组碱基对的体系而言, 其氢键的贡献明显大于碱基堆积作用. 相似文献
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