赖氨酸胍基化对蛋白质组分析的影响

赖氨酸胍基化在蛋白质组学定性和定量研究中起着重要作用,本文系统分析了胍基化前后,HeLa细胞蛋白质经胰蛋白酶酶解产生的3种不同类型肽段的质谱鉴定情况,并探讨了不同肽段质谱响应改变的内在原因。发现赖氨酸在侧链能选择性地发生胍基化反应（其选择性达到96.8%）,转化为高精氨酸,碱性增强。因此在正离子质谱模式下,C端为赖氨酸的肽段产生了更多的y离子,提供了许多新的离子碎片信息。在鉴定结果中,此类肽段所占总肽段的比例由原来的51.7%上升为57.3%,并且有1015条新的肽段被检测到。对于不含有赖氨酸的肽段,其鉴定结果在胍基化前后基本没有变化。结果表明,胍基化可以在一定程度上提高质谱鉴定的灵敏度和互补性,提高蛋白质分析的覆盖率。