腺嘌呤核苷磷酸的分子轨道研究

本文应用GNDO方法计算了AMP,ADP和ATP分子,而且用从头计算法研究了ATP分子。描述了这些分子的电子结构的主要特点,给出了它们的电离势、偶极矩和键级。讨论了ATP分子和金属离子以及酶分子的相互作用。     

STUDIES ON THE PROBLEM OF CONVERGENCE IN SCF ITERATIVE PROCESS OF QUANTUM CHEMISTRY

The divergence in SCF iterative process of quantum chemistry is the most common source of dif-ficulty for the calculations such as ab initio, INDO, CNDO, etc. We propose a new iterative formula call-ed "Diagonal Shift Formula" (DSF), and give its theoretical ptoOf. ln' Practice. Lundreds of mole-cules, laIge and small, and even the ones with unreasonable structures, have all successfully converged inat most l5 iterative steps. Thus the DSF metkod kas been proved to possess the general convergent capac-ity and fine numerical stability both in mathematics and practice. By CNDO we bave succe'sfully cal-culatcd the largest molecule in China, and the most important biomoIecu1e ATP which was once re-ported never converged. Both molecu1es have converged smoQthly by DSP method.     

绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力片段-牛胰蛋白酶复合物的晶体结构测定——分子置换法及3分辨率电子云密度图

本文以修正过的牛胰蛋白酶分子的坐标为模型,应用旋转函数法和平移函数法成功地求得了牛胰蛋白酶分子在绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力片段(以下简称MBILF)-牛胰蛋白酶(以下简称BTRY)复合物晶体晶胞中的取向和位置。从正确放置于MBILF-BTRY复合物晶胞中的BTRY分子的坐标出发,用Sim权重方法算得的一套相角作为MBILF-BTRY复合物的相角,以2丨F_0|—丨F_(?)丨为系数所得到的3分辨率的电子密度图中,除了投入计算的BTRY分子本身的电子密度外,在BTRY的活性部位附近可以清晰地看到MBILF分子所对应的电子密度及其边界,抑制剂片段的线度约为15×15×25。     

关于量子化学自洽场迭代中收敛问题的探讨

本文提出了一个新的迭代公式——对角位移公式,在理论上较严密地证明了该公式的收敛性;在计算实践中对上百个大、小分子(包括一些结构很不合理的分子)均可在15次迭代以内收敛,因而证明了该公式在理论和实践两方面都具有普遍收敛性和良好的数值稳定性。文中计算了国内目前用CNDO方法计算的最大的分子,并对量子生物学著作中提出的因自洽迭代发散而无法计算的ATP分子成功地进行了CNDO计算。