Sequence Dependence of Fluorescent Quenching of Chromophores Covalently Bonded to Oligo-DNAs before and after Duplex Formation

The labeling of oligo- and polynucleotides with fluorescent probes is an important technique for the analysis of DNAs and RNAs. The effect of duplex formation with complementary oligo-DNA on the quenching behavior of two fluorescent chromophores (eosin, Eo and tetramethylrhodamine, TMR) attached to the 5′-terminal of various 10mer oligo-DNAs was investigated and the dependence of the quenching on DNA base sequence is discussed. We found that guanine residues played a major role in the quenching of the fluorescence of the chromophores. Guanine residues on the complementary DNA near the chromophores, in particular, had a significant influence on the quenching.     

Structure and Polymorphism of M(thd)3 (M = Al,Cr, Mn,Fe, Co,Ga, and In)

Formation, crystal structure, polymorphism, and transition between polymorphs are reported for M(thd)₃, (M = Al, Cr, Mn, Fe, Co, Ga, and In) [(thd)^– = anion of H(thd) = C₁₁H₂₀O₂ = 2, 2, 6, 6‐tetramethylheptane‐3, 5‐dione]. Fresh crystal‐structure data are provided for monoclinic polymorphs of Al(thd)₃, Ga(thd)₃, and In(thd)₃. Apart from adjustment of the M–O_k bond length, the structural characteristics of M(thd)₃ complexes remain essentially unaffected by change of M. Analysis of the M–O_k, O_k–C_k, and C_k–C_k distances support the notion that the M–O_k–C_k–C_k–C_k–O_k– ring forms a heterocyclic unit with σ and π contributions to the bonds. Tentative assessments according to the bond‐valence or bond‐order scheme suggest that the strengths of the σ bonds are approximately equal for the M–O_k, O_k–C_k, and C_k–C_k bonds, whereas the π component of the M–O_k bonds is small compared with those for the O_k–C_k, and C_k–C_k bonds. The contours of a pattern for the occurrence of M(thd)₃ polymorphs suggest that polymorphs with structures of orthorhombic or higher symmetry are favored on crystallization from the vapor phase (viz. sublimation). Monoclinic polymorphs prefer crystallization from solution at temperatures closer to ambient. Each of the M(thd)₃ complexes subject to this study exhibits three or more polymorphs (further variants are likely to emerge consequent on systematic exploration of the crystallization conditions). High‐temperature powder X‐ray diffraction shows that the monoclinic polymorphs convert irreversibly to the corresponding rotational disordered orthorhombic variant above some 100–150 °C (depending on M). The orthorhombic variant is in turn transformed into polymorphs of tetragonal and cubic symmetry before entering the molten state. These findings are discussed in light of the current conceptions of rotational disorder in molecular crystals.     

渝东北地区龙马溪组页岩储层微观孔隙结构特征

为了系统描述渝东北地区下志留统龙马溪组海相页岩的微观孔隙结构,应用氩离子抛光聚焦离子束扫描电镜(FIB-SEM)、低温N2吸附及高压压汞实验定性和定量测试WX-1井岩心样品的孔喉形态、连通性、比表面积及孔径分布.通过对比分析不同实验测试的孔径分布,实现对页岩样品从微孔到宏孔的精细描述,并探讨了影响孔隙发育的控制因素.研究结果表明,龙马溪组页岩储层主要发育有机质孔、黏土矿物层间孔、黄铁矿晶间孔、颗粒边缘溶蚀孔及微裂缝等5种孔隙类型.受到后期压实作用的影响,有机质孔隙发育具有微观非均质性.纳米孔隙类型复杂、形态多样,主要为开放透气性孔,但存在细颈状墨水瓶孔及少量一端封闭的不透气性孔等影响页岩气的渗流;孔径分布具有“双峰”特点,纳米孔主要孔径为2～10 nm、30～90 nm,即直径＜100 nm的孔隙提供了大部分总孔体积,为页岩储层主要发育的孔隙类型.孔隙发育受多种因素的控制,直径≤50 nm微孔、中孔的发育与有机质有关,有机碳含量与微孔、中孔的孔体积呈正相关性;直径＞50 nm宏孔的发育与黏土矿物含量有关,随着黏土矿物含量的增加,宏孔的体积、比表面积也随之增大.     

川西拗陷雷四3亚段高频层序特征及控制因素

在川西拗陷中三叠统雷口坡组沉积背景研究基础上,通过岩心、薄片观察和测井、地震资料分析,运用层序地层学原理,研究雷四3亚段高频层序发育特征,对雷四3亚段进行精细层序地层对比,落实层序地层在研究区展布情况,探讨其发育控制因素及与储层发育的关系.雷口坡组可划分出2个Ⅲ级层序,雷四3亚段发育于第2个Ⅲ级旋回sQ2高水位体系域,进一步可识别出2个Ⅳ级层序和7个Ⅴ级层序.在高频层序划分的基础上,建立了雷四3亚段高频层序地层格架,以Ⅴ级层序为单元,对研究区雷四3亚段地层进行精细对比发现,层序地层横向具有较好的对比性,XS1井、DS1井、TS1井缺失顶部地层,分析认为与印支期地层剥蚀有关.川西拗陷雷四3亚段层序发育主要受海平面升降、构造运动及气候影响,Ⅴ级层序以向上变浅的旋回为主,溶蚀作用主要发育在Ⅴ级层序中上部,易形成优质溶蚀型储层.     

川西坳陷中段须四段钙屑砂岩储层特征及有利区块预测

钙屑砂岩通常较致密,储集性往往很差.在大量薄片鉴定及物性统计基础上,对须家河组T3x45砂组钙屑砂岩的岩石学、物性特征及其主要控制因素进行了详细研究,结果表明该套砂组的钙屑砂岩次生孔隙较发育,为有效的储集层,储层物性主要受控于沉积相、压实作用、溶蚀作用及构造作用等因素,其中溶蚀作用和构造破裂作用是储层发育最重要的控制因素.在储层特征及其与沉积相发育关系分析的基础上,以T3x45砂组为编图单元编制沉积微相图和砂体等厚图,预测钙屑砂岩储层平面分布特征,并对有利储层发育区块进行预测和评价,识别出3个具有较大勘探潜力的储集砂体.     

“非保护型”金属胶体纳米簇形成机理研究

碱-乙二醇法制备的"非保护型"金属及合金纳米簇由表面吸附的溶剂分子和简单离子实现稳定化,它们被广泛用于制备高性能复相催化剂和研究复相催化剂中的尺寸、组成、载体表面基团以及修饰剂对催化性能的影响。关于此类非保护金属纳米簇的形成过程及机理的认识尚有待进一步深化。本文采用原位快速扫描X射线吸收精细结构谱(QXAFS)、原位紫外-可见(UV-Vis)吸收光谱、透射电子显微镜和动态光散射技术研究了碱-乙二醇法合成中非保护型金属胶体纳米簇的形成过程与机理。结果表明,在碱-乙二醇法合成非保护型Pt金属纳米簇的过程中,室温下即有部分Pt(IV)被还原至Pt(II)。随着反应温度的升高,OH-逐渐取代与Pt离子配位的Cl-,在Pt―Pt键形成之前,反应体系的UV-Vis吸收光谱中可观察到明显的纳米粒子的散射信号,原位QXAFS分析表明Pt纳米簇是由Pt氧化物纳米粒子还原所形成的;在Ru金属纳米簇的形成过程中,OH-首先取代了Ru Cl_3中的Cl~-,形成羟基配合物Ru(OH) _6~(3-),后者进一步缩合形成氧化钌纳米粒子,最终Ru金属纳米簇由乙二醇还原氧化钌纳米粒子形成。由于先形成了氧化物纳米粒子,后续的还原反应被限制在氧化物纳米粒子内,使最终得到的非保护型金属纳米簇具有尺寸小、分布窄的特点。本工作所获得的知识对发展高性能能源转化催化剂、精细化学合成催化剂、传感器等功能体系具有重要意义。     

辽宁省连山关铀矿床绿泥石形成环境与铀矿化关系

采用电子探针分析技术,对产于辽宁省连山关花岗岩型铀矿床深部的绿泥石进行蚀变特征、化学组成、形成环境研究,并初步探讨该矿床中的绿泥石的形成环境与铀矿化关系。指出绿泥石的形成温度为242.54~286.89℃。与铀矿物共生的绿泥石主要是铁镁绿泥石、蠕绿泥石。含矿溶液沉淀时是一个还原环境,绿泥石不仅活化了花岗岩中的铀,同时还为铀矿化提供了良好的沉淀环境。     

下扬子五峰组上升流相烃源岩沉积特征

五峰组层状含放射虫硅质类地层是下扬子地区所发育的区域性优质烃源岩之一,为前陆挠折滞流盆地边缘斜坡上升流沉积产物。受上升流强度和阵发周期频率的控制,形成了多个厚度呈周期性变化、硅质生物组成略有不同的硅质岩和硅质页岩互层韵律沉积。五峰组沉积时期,水体缺氧程度高,有机质组成以无定形为优势,原始生烃潜力高,低等藻类和其它浮游生物是其主要生源。受上升流影响,硅质岩和硅质页岩沉积时期有机质的保护机制存在差异,有机质富集程度主要与粘土矿物对有机质较强的吸附和保护能力以及氧化硅矿物转化过程中有机质的损失相关。     

北羌塘拗陷巴贡组致密砂岩储层特征及控制因素

北羌塘拗陷的上三叠统巴贡组碎屑岩是羌塘盆地的储层重点层系,分析沉积、成岩作用对巴贡组碎屑岩储层物性的影响机制,可以为下步勘探工作提供地质依据.研究表明,巴贡组砂岩总体的成分成熟度和结构成熟度中等偏低,溶蚀孔隙是主要的孔隙类型,孔隙结构表现为分选差、喉道细和连通差.沉积因素是控制优质储层的主要因素,形成于分流河道微相的砂...     

云南曲靖下泥盆统桂家屯组一种新的工蕨类植物及栖生的微螺虫

记述发现于云南曲靖锅盖山剖面桂家屯组的一种早期维管植物。该植物茎轴裸露,根状茎以连续多次K型或H型分枝形成复杂的分枝系统,直立轴呈简单的二歧式分枝,孢子囊侧视呈匙形至卵形,螺旋状着生于穗轴上。该植物体型较小,保存较完整的根状茎,但孢子囊穗的保存状况较差,孢子囊结构不够清晰,无明显可见的孢子囊开裂线,因此将其暂定为cf. Zosterophyllum sp.。尽管如此,该植物展现的性状特征不同于典型的Zosterophyllum及其他相关属种,丰富了人们对早期维管植物形态变异及桂家屯组植物组合的认识。在cf.Zosterophyllumsp.的直立轴表面栖生大量微螺虫(microconchids)标本,直径为0.7～2.2 mm。微螺虫是一种已灭绝的水生无脊椎动物,发现于晚奥陶世到中侏罗世末期地层中,其壳体为螺旋状的钙质管,习惯固着在包括植物在内的各种硬质基体上。微螺虫在cf.Zosterophyllumsp.的直立轴栖生,表明该植物在生长期间曾被水体淹没,之后微螺虫伴随植物茎干被搬运和埋藏。