深海沉积物中产淀粉酶细菌的rep—PCR基因指纹分析

利用淀粉酶筛选培养基平板从27个深海沉积物样品中筛选得到30个具有胞外淀粉酶活性的菌株．其中革兰氏阴性细菌有22株．阳性细菌有8株．对这些细菌的基因组DNA进行ERIC—PCR和BOX—PCR扩增．指纹图谱显示大部分菌株均存在数目不等的各自独特的带型．各特异性扩增的主带型能重复稳定出现．比较两种引物的指纹图谱．显示ERIC—PCR比BOX—PCR具有较丰富的图谱多态性．对产生的指纹图谱进行聚类学分析．30株细菌可分为10组．其中5株细菌分别独立成组．最多的第Ⅱ组包含有8株细菌．而在同一聚类组内的细菌可能是处于进化上亲缘关系较近的位置．研究显示，30株菌具有丰富的种属多样性．揭示了深海微生物资源的丰富和潜力．ERIC—PCR和BOX—PCR技术可用于对深海微生物群落组成和多样性的研究．     

应用gE-MGB-TaqmanPCR方法检测冰冻动物组织样品

伪狂犬病毒是严重影响养猪业发展的重要病毒,病毒粒子具有较强的抵抗力。gE基因是伪狂犬病毒的毒力基因和gE-基因缺失疫苗的缺失基因。本实验应用gE-MGB-TaqmanPCR检测18份冰冻组织样品,阳性率为15/16(除2份弃去),与血清中和结合细胞MTT比色实验结果比较,符合率为100%。此方法以闭管的模式操作,减少了以后步骤污染的可能性,整个PCR检测过程少于2个小时。     

实时荧光定量PCR技术检测牙周炎致病菌中16S rRNA DNA探针的制备

利用实时荧光定量PCR和细菌16S rRNA测定技术制备牙龈卟啉菌染色体探针,并进行检测,为进一步研究牙周病可疑致病菌提供方法.主要方法是:厌氧环境下培养牙龈卟啉菌,抽提细菌DNA;根据基因库已知牙龈卟啉菌16S rRNA DNA序列,设计特异性的TaqMan探针和一对引物;经实时荧光定量PCR仪进行细菌DNA样本的PCR反应获得反应曲线.结果表明,细菌DNA样本经PCR反应后,在15个循环时,开始出现扩增曲线,此后荧光逐渐增强,在26个循环后达峰值.由此可见,利用细菌16S rRNA技术制备致病菌染色体探针,经实时荧光定量PCR测定,可以对目标微生物进行准确定性和定量.     

SLE患者血清抗Sm抗体免疫PCR的方法学评价

目的为SLE患者血清抗Sm抗体提供免疫PCR测定方法.方法评价免疫PCR方法检测抗Sm抗体的特异性、敏感性、重复性和相关性.结果免疫PCR方法测定SLE患者血清抗Sm抗体特异性强,敏感性是ELISA方法的107倍,而且与ELISA方法呈高度正相关.结论免疫PCR方法用于血清抗Sm抗体测定具有临床实用价值.     

转基因花卉的DNA提取与多重PCR分析

分别以CTAB法、DNA提取试剂盒提取菊花、矮牵牛、非洲菊3种花卉的基因组DNA，凝胶电泳结果表明试剂盒提取的效果较好。设计合成了3对引物，分别扩增花椰菜花叶病毒（Cauliflower mosaic virus,CaMV)35S启动子、根癌农杆菌胭脂碱合成酶基因（nos）终止子、大肠杆菌K12菌株新霉素磷酸转移酶Ⅱ(nptⅡ）基因。普通PCR检测结果表明，3种花卉6个样品中仅矮牵牛的1个样品含有这3种转基因成分，酶切鉴定结果验证了PCR产物为非假阳性。尝试以多重PCR同时检测转基因矮牵牛与对照阳性质粒中的2个或3个转基因成分，得到预期结果。     

小鼠胰岛素样生长因子结合蛋白7原核表达载体的构建

胰岛素样生长因子结合蛋白7（简称IGFBP7）广泛存在于多种正常的组织中，但在相应的肿瘤细胞中的含量极微。试验表明，它在肿瘤发生的不同阶段抑制其生长。采用RT－PCR和Nest-PCR方法，从正常的小鼠脾脏中扩增得到IGFBP7 cDNA片段，测序正确后，克隆于融合表达载体pRSETC中构建原核表达重组体。     

石蒜单染色体的显微分离及体外扩增

建立了石蒜单染色体的分离及体外扩增的方法。石蒜根尖经卡诺固定液固定后，再用果胶酶和纤维素酶酶解处理，制得标本，在倒置显微镜下，用自制的毛细管针挑取目的的染色体。将分离的石蒜染色体放入0．2mLEppedorf管中，经蛋白酶K处理后，进行DOP－PCR扩增，获得DNA片段。琼脂糖凝胶电泳显示扩增产物的长度大约为100－5000bp。此法为构建石蒜单染色体基因组库和筛选其特异性探针奠定了基础。     

深圳市公共汽车车厢内空气中菌落总数污染状况调查及防治对策探讨

对深圳市运行途中的公共汽车空调车厢、非空调车厢内空气中菌落总数的调查表明:深圳市空调车厢内空气中菌落总数较非空调车厢高。空调车厢内空气中菌落总数一年四季均超出标准限值,菌落总数污染程度由高至低分别为春、冬、秋、夏,春冬季超标严重。非空调车车厢内空气中菌落总数秋夏季均值未超出标准限值,春冬季超标有一定程度超标,污染程度由高至低分别为冬、春、秋、夏。两种车型上下班高峰期菌落总数污染程度普遍比运行平缓期高。     

HCV基因分型在丙肝诊断和治疗中的应用

目的 建立ＨＣＶ基因分型方法，研究ＨＣＶ基因型与肝病程度的关系，探讨ＨＣＶ基因型与ＩＦＮ－ａ２ｂ抗病毒疗效的关系。方法 ＨＣＶ基因组ＮＳ５区ＰＣＲ扩增产物酶切分型。结果 ７３例ＨＣＶ感染者中有ＨＣＶⅡ型４５例，ＨＣＶⅢ型２８例。Ⅱ型ＨＣＶ感性肝炎３１例，肝硬化１４例；Ⅲ型ＨＣＶ感染者中有慢性肝炎２６例，肝硬化２例。Ⅱ型ＨＣＶ感染者的肝硬化发生率显著高于Ⅲ型ＨＣＶ感染者（Ｐ〈０．０５）。所有病人均应     

High-quality reference genes for quantifying the transcriptional responses of Oryza sativa L. (ssp. indica and japonica) to abiotic stress conditions

Rice (Oryza sativa L.) is important to food security and is also an excellent model plant for numerous cereal crops. A functional genomics study in rice includes characterization of the expression dynamics of genes by quantitative real-time PCR (qPCR) analysis; this is a significant key for developing rice varieties that perform well in the face of adverse climate change. The qPCR analysis requires the use of appropriate reference genes in order to make any quantitative interpretations meaningful. Here, the new potential reference genes were selected from a huge public database of rice microarray experiments. The expression stability of 14 candidates and 4 conventional reference genes was validated by geNorm PLUS and NormFinder software. Seven candidates are superior to the conventionally used reference genes in qPCR and three genes can be used reliably for quantitating the expression of genes involved in abiotic stress responses. These high-quality references EP (LOC_Os05g08980), HNR (LOC_Os01g71770), and TBC (LOC_Os09g34040) worked very well in three indica genotypes and one japonica genotype. One of indica genotypes including the Jasmine rice, KDML105 developed in Thailand for which no reference genes have been reported until now.