BioStarM-140s芯片基因信息查询系统的构建及应用

应用生物信息学数据库查询的方法,对B ioS tarM-140s小鼠基因表达芯片上的14 112个基因进行相应注释信息的查询和所对应蛋白质功能的分类.首先参照人类综合型芯片上基因的功能分类,设定了14个蛋白质类别,然后采用V isual C 编程语言,构建了基因信息查询系统.应用该查询系统,进行了网络生物学数据库信息资源的自动直接查询,共搜索到有注释信息的基因12 070个;进一步按照所设定的14个蛋白质类别对12 070个基因进行分类查询,搜索到了与这14个分类相符合的、具有详细蛋白质功能注释信息的基因共1 606个.     

氯过氧化物酶活性中心结构域中Mn2+与酶催化行为的关系

通过乙二胺四乙酸二钠(EDTA)配位竞争反应结合石墨炉原子吸收及电感耦合等离子体发射检测结果,为氯过氧化物酶(CPO)活性中心血红素丙酸根与金属Mn2+配位结合提供了更直接的证据;基于Mn2+移除前后CPO的紫外特征吸收光谱、圆二色谱以及氯化活性和过氧化活性的变化,阐明了Mn2+的存在对于保持酶活性中心的结构域、稳定CPO的优势构象具有一定作用,是酶分子表现活力所必需的结构元素.本研究还发现移除Mn2+前后CPO血红素活性中心微环境的变化是一个可逆过程,重新引入Mn2+后活性可恢复,并且以外源性Ag+和Cr3+替代Mn2+后,CPO的氯化活性和过氧化活性分别比天然态的酶有所改善,为通过化学修饰提高CPO的催化活性提供了新的途径.     

硝酸铈对Calpain基因表达的影响

运用逆转录聚合酶链式反应研究了硝酸铈对大白鼠肝脏Calpain Ⅰ、Calpain Ⅱ基因表达的影响。腹腔注射高浓度硝酸铈可引起Calpain基因表达的变化，提示硝酸铈对肝细胞的损伤可能是因为细胞内钙超负荷所致。     

Cloning, Expression and Purification of Wheat Acetyl-CoA Carboxylases CT Domain in E. coil

The entire gene of carboxyltransferase（CT） domain of acetyl-CoA carboxylase（ACCase） from Chinese Spring wheat（CSW） plastid was cloned firstly, and the 2.3 kb gene was inserted into PET28a^＋ vector and expressed in E. coil in a soluble state. The （His）6 fusion protein was identified by SDS-PAGE and Western blot. The recombinant protein was purified by affinity chromatography, and the calculated molecular mass（Mr） was 88000. The results of the sequence analysis indicate that the cloned gene（GeneBank accession No. EU124675） was a supplement and revision of the reported ACCase CT partial cDNA from Chinese Spring wheat plastid. The recombinant protein will be significant for us to investigate the recognizing mechanism between ACCase and herbicides, and further to screen new herbicides.     

基于遗传算法SVM的基因表达谱数据分析

提出一种基于遗传算法的数据挖掘方法——TGASVM,它能够尽可能少地选出分类能力强的信息基因.实验表明与同类的算法相比,TGASVM算法无论是分类准确率,还是挑选信息基因数目都优于同类算法.     

视网膜母细胞瘤基因产物磷酸化水平与细胞生长状态的关系

随着无血清培养细胞时间的延长，红胞合成Ｒｂ蛋白量和磷酸化水平逐渐降低，当细胞生长停止时，Ｒｂ蛋白处于低磷外化状态．正丁酸钠可诱导ＨＬ６０终端分化为单核－巨噬细胞；视黄酸、二甲基亚砜使ＨＬ６０分化为粒细胞．尽管分化途径不同．但是终端分化的细胞都只能合成低磷酸化的Ｒｂ蛋白．结果表明当细胞处于生长停滞状态，细胞都只能合成低磷酸化的Ｒｂ蛋白．     

DNA重组体技术在作物改良中的应用

引言近几十年来,DNA技术已获得重大进展。尽管遗传工程仍处在发展阶段,但它必将成为控制植物特性的一种强有力的工具,诸如除草剂与杂草的竞争性、光合效率、营养增强能力、应激忍耐力、固N能力和次生植物再生的生产。传统的常规遗传控制手段是进行品种改良的育种方法。植物的育种,就是从具不良性状的亲本杂交后代中选择优良性状,也许同时存在一个或两个以上的性状是不需要的。植物育种的一个典型的步骤,通常是通过选择优     

后基因知识发现中有选择的课题

大信息通过量序列与功能基因组技术绘制了人类基因序列图，并且使得大规模人类群体基因型与基因表达的特征勾画成为可能，进一步的研究是对基因组序列的准确注释、基因组与蛋白质之间相互作用和物种的遗传变异性上。基因组注释过程越来越以涉及进化研究和模型生物体的比较方法作为依据。DNA与蛋白质之间的相互作用是生物学相互作用中最基本的，而且在生物学、医学和药物学中具有普遍的意义。     

水稻基因表达谱分析寡核苷酸芯片制备的研究

 首先有目的地搜集了50个水稻花序相关基因,进行了探针的设计、筛选及合成纯化,用点样仪以微阵列的形式将其点于醛基化的玻璃片上;将3个不同生长阶段的水稻花序材料的总RNA经荧光标记反转录后与寡核苷酸芯片进行杂交.用ScanArray3000对获得的表达谱进行扫描分析显示,芯片图像背景均匀,信号清晰.用ImaGene4.0软件对表达谱分析表明,候选基因在水稻花序3个不同发育阶段的材料中,表达水平有显著差异.为进一步进行水稻寡核苷酸芯片的制备及应用奠定了基础.     

5种细胞周期调控基因在小鼠生殖细胞发育过程中的表达研究

 以成熟(10周龄以上)的昆明种正常小鼠的精巢和卵巢为材料,利用地高辛标记的基因探针进行组织切片上的DNA-mRNA分子原位杂交,研究了PCNA,cdc2,cyclin D1,p2 1和 p16 5种细胞周期调控基因在生殖细胞发育过程中的表达.结果表明:PCNA基因在睾丸组织的精原细胞和精母细胞中有强杂交信号,而在雌性生殖细胞及滤泡细胞的发育过程都没有杂交信号;cyclin D1,cdc2,p2 1,p16基因在生殖细胞的发育过程中都没有,表明这些基因并没有参与小鼠生殖细胞的生长和分化调控.这些事实表明在生殖细胞发育过程中,控制细胞增殖和增殖抑制的基因与培养细胞有不同的机制,它们可能采用了不同的调控系统.