病毒基因组中的对称性

病毒基因组中的重复序列比率很低,因为其核酸序列大都是编码区域.如果出现一段同向对称或者是反向对称序列在病毒基因组中,它往往代表一个调控元件,或者是一个信号因子.我们总结了病毒中的一些对称序列,并阐明它的特点,分布及功能.     

中国科学家破译小菜蛾基因组

<正>编辑圈点:号称"蔬菜杀手"的小菜蛾以其超强的繁殖能力为祸不浅,尤其是对十字花科蔬菜有着天生的"喜好"。小菜蛾分布范围广、抗药能力强、生存力旺盛、破坏性大。福建农大联手深圳华大基因研究院通过基因组解密,找到了小菜蛾的"软肋"——植食性和解毒能力。基因工程技术的普适,将使一些害虫遭遇灭绝,预示着农业生产又有了新技术、新方法。     

罕见变异关联分析中的统计方法研究进展

二代测序数据的持续增多以及全基因组关联分析存在着只关注常见变异对表型影响的缺陷,使得研究人员开始考虑罕见变异对表型表达的影响。近年来,涉及罕见变异关联分析的统计方法研究成为一个活跃的领域,大批统计检验方法被相继提出。然而,大多数方法没有得到全面详细的比较和分析。因此,缺乏对现有方法的评价以及对它们如何使用的指导。本文对该领域的一些具有代表性的方法做一全面的综述,并介绍一些最新的研究进展。     

慢性肾功能衰竭大鼠肾皮质基因组DNA表观遗传学变化的MSAP分析

以灌胃腺嘌呤诱导的慢性肾功能衰竭Wistar大鼠为实验材料,用高效液相色谱法(HPLC)检测了大鼠血清Hcy浓度的变化；应用甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)技术,检测了慢性肾衰大鼠肾皮质基因组DNA甲基化程度的变化,并对M...     

关键词

10月30日，南京师范大学、华大基因等单位的科研人员成功破泽了白暨豚全基因组图谱，为解析白黯豚独特的生活爿性及进化历程奠定了重要的遗传学基础，同时也为哺乳动物尤其是鲸类的研究与保护提供了宝贵资源。     

兰花基因组计划：探索生命进化之谜

从达尔文开始，在随后的200多年时间里，兰花一直是进化生物学家关注的焦点，对它们的观察和研究从来没有停止过。1903年，喙长25厘米的天蛾的发现，证实了达尔文关于彗星兰传粉者的预测；2003年，眉兰花香成分的测定，证实了这种兰花是依靠释放假的“性激素”来诱骗雄胡蜂传粉的。越来越多的研究，让我们逐步认识了千奇百怪的兰花。     

灵芝基因组框架图已经完成

《自然通讯》(Nature Communications)6月报道,有着"不死药"美誉的中国仙草——灵芝(Ganoderma lucidum),其基因组框架图已于近日绘成。该项目由中国医学科学院药用植物研究所、美国田纳西州大学健康科学中心和威斯康星大学麦迪逊分校等机构的研究人员联合完成,通讯作者是中国医学科学院药用植物研究所的陈士林所长和孙超博士。灵芝,不仅在中国久负盛名,在世界范围内也是众所周知的一种药用大     

Accurate localization and excision of genomic islands in four strains of <Emphasis Type="Italic">Pseudomonas aeruginosa</Emphasis> and <Emphasis Type="Italic">Pseudomonas fluorescens</Emphasis>

Mobile genomic islands (GIs) can be excised from the chromosome, then form a circular intermediate and be reintegrated into the chromosome by the GI internal integrase. Some mobile GIs can also be transferred into a new receptor cell by transformation, conjugation, or transduction. The action sites of the integrase are usually flanked direct repeats (DRs) of the GIs. Accurate localization of the flanking sequences is a precondition for determining the mobility of the GI. Mobile GIs are generally associated with transfer RNAs (tRNAs). Based on the correlation between flanking sequences and tRNA sequences, the flanking sequences of 11 putative mobile GIs in Pseudomonas aeruginosa PAO1, P. aeruginosa PA14, P. fluorescens Pf-5 and P. fluorescens Pf0-1 were identified. Among the 11 GIs, Pf0-1GI-1 is responsible for benzoate degradation. PAO1GI-1, Pf5GI-2, Pf5GI-3, and Pf5GI-4 were confirmed experimentally to be excised from a chromosome to form a circular intermediate. The action sites of the integrases are these GIs direct repeats. Due to distinct DRs, cutting sites for the internal integrase of PAO1GI-1, Pf5GI-2, Pf5GI-3 and Pf5GI-4 were determined outside the T-loop of the tRNA^Gly gene, outside the anticodon loop of the tRNA^Ser gene and tRNA^Lys gene, and at the asymmetric 3′-end of the tRNA^Leu gene, respectively. PAO1GI-1 and other mobile GIs may be transferred into many different strains that belong to different phyla because of the clear flanking sequences. This study describes basic information about the action sites of the integrases, assesses the mobility of GIs, and can help design and transfer mobile GIs to candidate strains.     

DNA damage,signaling and repair: Protecting genomic integrity and reducing the risk of human disease

DNA is the genetic material that contains the "instructions" to not only guide the continuation of life but also govern the development, metabolism and functioning of living organisms. DNA damage occurs daily due to various exogenous (environ-     

C─值悖论及其机制

基因组大小，即Ｃ值，与基因组中所含的遗传信息的认定数量间缺乏对应，这种Ｃ一值悖论是由非基因ＤＮＡ的增加所造成的．