人类基因组计划研究进展

综述了“人类基因组计划”的产生与目标、内容、基本策略、技术背景、成果、意义、后基因组学和中国“人类基因组计划”的研究等问题．     

蜡状芽孢杆菌ATCC 10987基因组蛋白质编码基因的重新注释与分析

蜡状芽胞杆菌ATCC 10987对于细菌比较基因组学的研究有重要意义.但其染色体中基因的数目被RefSeq注释为5 603个,这个注释是有疑问的.本文采用Zcurve和Glimmer程序联合打分的方法来识别其蛋白质编码基因.为保证预测结果的可靠性,对联合判别附加预测的基因使用了BLAST方法进行数据库同源性搜索.结果,蜡状芽胞杆菌ATCC 10987基因组中的蛋白质编码基因的数目被重新确定为5 180个.这个数目明显低于原始注释的数目,并且一些指标表明新的注释更为可信.这些相对正确的基因集合为该细菌亲缘物种的深入研究提供了基础.     

人与其他生物基因组若干重要问题的生物信息学研究

Z曲线是表示DNA序列的一个等价的三维空间曲线.通过对Z曲线的研究来对基因组序列进行研究是一种几何学的途径.用这种思路研究了真核和原核基因组中若干重要问题,包括人与高等真核生物基因组的Isochore结构,微生物基因组的基因水平转移,古细菌基因组复制起始位点识别,酶母基因组基因识别,细菌与古细菌基因组的ab initio基因识别,SARS-CoV基因组基因识别,高G C含量微生物基因组的结构以及比较基因组学等的研究.文中综述了天津大学生物信息中心最近6年来在上述研究中所取得的进展.     

DNA分子标记在水稻遗传育种中的应用

综述了近年来DNA分子标记在水稻分子遗传图谱的构建、遗传资源保存和遗传多样性分析、基因的标记及克隆、比较基因组学研究、分子标记辅助育种等方面研究的应用及存在的问题，展望了其应用前景。     

基于扩增子测序的瘤胃内含物中木聚糖酶基因多样性研究

采用高通量扩增子测序技术,对山羊瘤胃微生物宏基因组第10家族(GH10)和第11家族(GH11)木聚糖酶基因多样性进行分析.经序列拼接、过滤和可操作分类单元聚类(<95%),获得348个GH10木聚糖酶基因. GH10木聚糖酶基因片段与GenBank数据库中已知蛋白序列的一致性为46%～97%,其中一半以上的序列与已知木聚糖酶的一致性低于80%.序列注释结果表明,GH10木聚糖酶基因分布于5个门,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为优势门.经序列处理分析,获得143个GH11木聚糖酶基因,与GenBank中已知蛋白序列的一致性为51%～100%. GH11木聚糖酶基因分布于6个门,其中子囊菌门(Ascomycota)和放线菌门(Actinobacteria)为优势门.基于片段序列和染色体步移技术,获得两个新的全长木聚糖酶基因,由其编码的蛋白具有特殊的结构域组成.本研究表明,山羊瘤胃环境中GH10木聚糖酶基因的多样性远高于GH11,且两者的分布存在较大差异.此外,该环境中还存在大量的新木聚糖酶基因,可为后续木聚糖酶基因资源的发掘和应用奠定基...     

幽门螺杆菌 N-末端肽序列的模式分类

针对胃病原体幽门螺杆菌Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ基因组对象相关的Ｎ－末端肽序列,提出了一种新的基于粗糙集的模式分类器方法,并阐述了相应的设计过程;所构造的模式分类器模型具有灵活的粗糙集表示结构,并与有效的粗糙集模式分类机制有着有机的联系．该方法不仅在非确定性信息处理方面具有理论意义,而且在将高新科技手段应用于生命科学前沿领域方面,是一种非常有益的探索,相应的计算机实验结果表明了该研究方法的有效性和实用性．     

DNA和RNA的结构基因组学研究的应用前景

人类基因组计划的实施产生了大量的基因数据，如何利用这些数据是后基因时代生物学研究的主要内容。结构基因组学就是利用这些数据和计算机模拟技术建立模型来为人类服务，介绍了DNA和RNA的结构基因组学的主要研究内容和进展，讨论了结构基因组学的商业应用前景。     

华东师大构建我国首批“试管猴”

华东师范大学脑功能基因组学研究所孙强博士领导的西双版纳灵长类模式动物中心科研小组成功构建了中国首批“试管猴”。有关专家认为,这一重要研究成果将为今后人们在脑科学研究、转基因模式动物构建等方面提供坚实的基础。     

桑格:解开人类基因密码

正桑格当之无愧地被称为"基因组学之父",他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展弗雷德里克·桑格,英国生物化学家,他完整定序了胰岛素氨基酸序列,证明蛋白质具有明确构造,     

基于组学的食品表征识别与鉴伪研究

食品表征识别与真伪鉴别已成为新时期食品质量安全领域的新兴研究热点和重要研究内容,应用于食品鉴伪的新技术新方法不断涌现,开展研究工作的队伍和人员不断壮大。从食品掺假与欺诈的历史发展、影响程度、内涵演变、技术问题等方面,分析了食品打假鉴伪的重要性与紧迫性,概述了基于基因组学、蛋白组学、代谢组学和无损检测技术的食品表征识别与鉴伪研究现状,并对不同方法的特点进行了分析。指出了我国食品打假鉴伪科技工作存在的主要问题和对策建议,并对食品表征识别与鉴伪技术的发展趋势进行了展望。