Glutamine: fructose-6-phosphate amidotransferase (GFAT): homology modelling and designing of new inhibitors using pharmacophore and docking based hierarchical virtual screening protocol

Glutamine: fructose-6-phosphate amidotransferase (GFAT), also termed GFPT1 and GFAT1, catalyzes the first committed step of the hexosamine biosynthesis pathway in mammals and consequently plays an important role in type 2 diabetes. In the present study, a combination of pharmacophore modelling, homology modelling, and molecular docking analysis was performed to design new glutamine competitive inhibitors of human GFAT, and to investigate important interaction details of inhibitor molecules. A pharmacophore model of GFAT inhibitors was developed, subsequently validated, and utilized for the screening by the PHASE database to identify new molecules. Afterwards, homology modelling was performed to construct the glutamine-binding site of the GFAT protein. The modelled active site was utilized to dock the studied molecules to investigate important receptor-ligand interactions and to scrutinize database-screened molecules on the basis of essential interactions. This systematic in silico protocol helped us to identify new molecules that would be explored for the treatment of type 2 diabetes and its complications.     

Phase unwrapping by accumulation of residual maps

We present a path independent (global) algorithm for phase unwrapping based on the minimisation of a robust cost function. The algorithm incorporates an outlier rejection mechanism making it robust to large inconsistencies and discontinuities. The proposal consists on an iterative incremental scheme that unwraps a sub-estimation of the residual phase at each iteration. The sub-estimation degree is controlled by an algorithm׳s parameter. We present an efficiently computational multigrid implementation based on a nested strategy: the process is iterated by using multiple resolutions. The proposal׳s performance is demonstrated by experiments with synthetic and real data, and successfully compared with algorithms of the state of the art.     

一种通信距离最小化的虚拟机分配算法

为了解决云资源分配过程中虚拟机通信距离较大,造成用户计算任务完成时间延长问题,提出一种最短通信距离的虚拟机分配算法.云资源管理器能够根据用户指定的虚拟机条件,将计算任务分割到合适的数据中心及其内部服务器,大大缩短了虚拟机之间的通信距离.仿真实验表明,与现有的贪婪算法和随机方法相比,提出的方法通信量更少,执行速度更快.     

基于虚拟技术的物理仿真实验系统的设计

随着信息技术的高速发展,虚拟现实技术在众多领域得到了广泛应用,本文基于此,采用B/S三层架构,结合Microsoft Visual C++2010及3D技术,构建了基于虚拟技术的物理仿真实验系统。     

基于跨度和虚拟层的三维芯核测试外壳扫描链优化方法

为减少三维芯核绑定前和绑定后的测试时间,降低测试成本,提出了基于跨度和虚拟层的三维芯核测试外壳扫描链优化方法.所提方法首先通过最大化每条测试外壳扫描链的跨度,使得绑定前高层电路和低层电路的测试外壳扫描链数量尽可能相等.然后,在TSVs(Through Silicon Vias)数量的约束下,逐层的将虚拟层中的扫描元素分配到测试外壳扫描链中,以平衡绑定前后各条测试外壳扫描链的长度.实验结果表明,所提方法有效地减少了三维芯核绑定前后测试的总时间和硬件开销.     

面向球面虚拟实景底部空洞的快速修补算法

本文提出一种针对球面虚拟实景底部空洞的快速修复算法,首先获取球面全景与球面虚拟实景间映射关系,并基于不同时刻球面虚拟实景间的空间位置关系建立位置映射模型,然后通过求解得到不同时刻球面全景之间的对应关系并实现缺失部分的修补,最后通过对修补区域亮度的调整及边缘融合,对修补结果进行优化.理论分析和实验结果均表明,该方法利用底部空洞位置固定这一特点建立复杂度仅为O(n)的修补算法,能够快速有效的实现球面实景底部空洞的修复.     

用于梳状结构光学测速系统的周期优化方法

为了提高梳状结构光学测速系统的测速精度,采用数学原理研究了梳状结构的间距大小对输出光强信号周期性的影响,通过优化输出光强信号的周期性来提高测速精度,并采用一种结合图像处理选择最佳间距的实验方法,进行了相关的理论分析,对两种不同路面进行了实验仿真验证,得到不同间距下不同的输出光强信号的周期性情况。结果表明,当栅状结构的间距大小与地面特征点大小一致时,得到的输出光强周期性最优,对于普通的柏油和水泥路面,对应到地面的最佳栅状结构间距大小为1.0mm ~1.5mm。     

基于激光视觉原理测量玻璃中气泡的尺寸

为了实现玻璃中气泡尺寸的在线测量,基于激光视觉原理,采用线结构激光器、线阵CCD相机和运动控制系统在实验室搭建玻璃气泡的动态测量系统。投射到玻璃表面的线结构激光光斑经变焦镜头成像在相机的光敏阵列上,相机的横向扫描与运动平台的纵向扫描配合,利用Sapera CamExpert图像采集软件获得玻璃气泡的灰度图像;理论上讨论了图像的纵向和横向精度,给出了气泡图像失真的判断依据及工作像素时钟频率与玻璃板纵向运动速率之间的匹配关系;采集了不同纵向运动速率下气泡的灰度图像,利用Sapera Architect软件测量气泡图像的横向和纵向像素数,通过理论计算得出气泡的横向和纵向尺寸,并与直尺测量结果比较,发现纵向尺寸相对误差为0.18,横向尺寸相对误差为0.05。结果表明,在相机工作距离、焦距和像元尺寸确定的情况下在误差允许的范围内该系统可以用来测量气泡的横向尺寸。     

数字化三维虚拟演播室系统方案设计

数字化三维虚拟演播室系统将摄像机现场拍摄人物活动图像和三维虚拟物体图像制作进行数字化的实时完美结合.首先介绍了数字化三维虚拟演播室的特点,然后叙述了三维虚拟演播室系统项目需求,最后从设计原则、系统结构设计、系统设备、系统显著特点等方面阐述新余台数字化三维虚拟演播室系统的设计方案.     

虚拟系统使用经验中的创新发明

根据多年使用各类虚拟系统的经验,通过对不同品牌摄像机、云台、传感跟踪装置等虚拟系统配套设备的研究,自主研发了通过摄像机光缆传输虚拟系统传感跟踪数据的设备,创新集成化虚拟系统的数据传输,简化了虚拟系统搭建流程,提高了系统稳定性.