2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷构象稳定性的理论研究

采用密度泛函方法在B3LYP/6-31＋G**水平上研究了2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷分子(D4G)的构象. 分别研究在气相中的孤立分子和一水合物异构体的相对稳定性和异构体之间的相互转变过程, 分析了水分子的参与对D4G异构体的相对稳定性和几何结构参数以及自然电荷的影响. 结果表明, 孤立的D4G分子在气相中存在8种稳定构象, 其中构象d4g-2是所有构象中最稳定的, 气相中D4G主要以d4g-2存在. 气相中各构象的相对稳定性为: d4g-2＞d4g-1＞d4g-5＞d4g-3＞d4g-6＞d4g-4＞d4g-8＞d4g-7. 计算得到的各构象键长和键角数据与实验值接近. 一个水分子的加入对D4G分子的构型参数有所影响, 基本不改变D4G分子各构象的稳定性顺序, 但构象转变的能垒有所提高. 氢键在分子构象中发挥了重要作用.     

十六烷基三甲基溴化铵水溶液热致相变的红外光谱研究

在280～320K的温度范围内考察了30％十六烷基三甲基溴化铵水溶液的红外光谱随温度的变化。结果表明该体系的凝聚胶-液晶相转变温度为300K。在300K以下的凝聚胶相,分子的极性头部基团处于高度“固定”的状态,分子的碳氢链以有序的相互平行方式排列,极性头与碳氢链之间有一定的倾斜角。在300K以上的液晶相,极性头内部CH_3-(N~+)基团以及整个极性头与碳氢链之间发生了旋转,碳氢链变为以六方亚晶胞填充形式存在,旦扭曲式构象异构体数量显著增多,极性头与碳氢链之间已不存在倾斜角,分子的亲水极性头和疏水碳氢链部分都处于“融化”状态。     

（E）—2—甲基—1,3—戊二烯的振动光谱及其稳定构象的研究

记录了（Ｅ）－２－二甲基－１，３－戊二烯的固，液，气态ＦＴＩＲ光谱（４００～４０００ｃｍ＾－１）和固、液态Ｒａｍａｎ光谱（５０～４０００ｃｍ＾－１），观测了６８５及６５８ｃｍ＾－１谱线的变温ＦＴＩＲ光谱（－７３～１０℃），对所得谱图进行了指认分析发现，该化合物存在两种单键旋构象异构体ｓ－ｔｒａｎｓ和ｓ－ｃｉｓ，由变温ＦＴＩＲ光谱峰强度随温度的变化得到了这两种构象互变的△Ｈ＾０和△Ｓ＾０。     

新冠病毒刺突蛋白及其受体的结构与相互作用

Biochemistry is a branch subject of chemistry, which is the study of chemical structures and processes associated with living organisms. COVID-19 pandemic is a problem for human beings. From the perspective of biochemistry, this paper demonstrates the chemical structure and interactions of SARS-CoV-2's spike protein and its receptor (human angiotensin converting enzyme 2), and summarizes the related research progresses. The authors hope to provide insights for the development of COVID-19 vaccine.     

RS—联萘酚膦酰胺晶体结构及与其S体分子力学计算结果的比较

测定了Ｏ，Ｏ（２，２＇－联萘基）－Ｎ－（α－苯基乙基）膦酰胺ＲＳ体与乙醇形成的分子化合笺晶体结构。晶体学数据为：Ｃ２８Ｈ２２ＮＯ３Ｐ．Ｃ２Ｈ５ＯＨ，Ｍｒ＝４９７．５，单斜晶系，Ｐ２１空间群，ａ＝９．３５９（２），ｂ＝１２．８０６（３），ｃ＝１１．６４１（Ａ），β＝１１１．６２（３）°，ｚ＝２，ｖ＝１２９４，０（５）ａ＾３，Ｄｃ＝１．２７７ｇ／ｃｍ＾３，ＭｏＫａ（λ＝０．７１０７３Ａ）射线，μ＝１．     

N-苄叉基-1-氨基-萘及其类似物的构象与分子扭曲的共轭 驱动力

确定了N-[(4-二甲基氨基)-苄叉基]-2-氨基苯并咪唑(1)，N-[(4-二甲基氨基)-苄叉基]-2-氨基苯并噻唑(2)和N-苄叉基-1-氨基-萘(3)的晶体结构。利用AM1，RHF，DFT方法和STO-3G,4-31G,6-311G及6-311G基组，优化每个分子的23个扭曲构象(θ=0°～-89°)。尽管不同方法得到的最优构象的扭角不同，分子扭曲的驱动力总是起因于电子作用，在任一分子、任何电子态中，离域的π体系总是失稳定的，全平面构象不是π体系最稳定的构象。π电子的离域是分子扭曲的驱动力之一，与经典观点相反，非键原子间的核排斥作用是分子扭曲的阻力，而不是动力。     

α-单取代环十二酮构象的研究

利用分子力学计算，单晶X射线分析和~1H NMR技术研究了α-单取代环十二酮 的构象。结果表明，它们的优势构象的环骨架仍是[3333]构象，而羰基则在2-C位 置上。在晶体中，它们的优势构象为α－角顺取代[3333]-2-酮构象，而在溶液中 则取α－角顺取代和α－边外取代[3333]-2-酮两种构象，且两种构象处于动力学 平衡之中，以α－边外取代[3333]-2-酮构象占优势。     

藻胆蛋白的Langmuir-Blodgett膜——Ⅰ.R-藻红蛋白单分子膜及蛋白构象变化的研究

测定了R-藻红蛋白(R-PE)在气/液界面上的表面压-面积曲线(tt-A等温线),结果表明R-PE具有很好的成膜性能,且由n-A等温线求得的单分子占有面积与R-PE以盘状形态“平躺”于液面上时的分子占有面积相同。R-PELB膜的透射电子显微镜(TEM)图象和椭圆偏振关于R-PE单分子膜厚度的测定,说明R-PE分子在基片上的取向是其盘平面与基片表面平行。根据这些依据,提出了R-PE单分子膜的结构。将R-PE在气/液界面上形成的单分子膜在适当表面压下用LB技术转移到基片上,测得了蛋白累积单分子膜的吸收及荧光光谱,R-PE单分子膜的吸收和荧光光谱与其在水溶液中无显著差别。膜的CD光谱与R-PE水溶液的CD光谱比较说明,当R-PE成膜后其二级结构发生了变化,即蛋白的p-折叠片构象组分增加。     

THE PREPARATION AND STUDY ON THE NANO-TiO2/SILK FIBROIN COMPOSITE FILMS BY THE SOL-GEL METHOD

Based on the sol-gel technique using butyl titanate as oxide precursor, the regenerated SF (silk fibroin)/nano-TiO2 composite films were synthesized. Different amounts of butyl titanate to SF were used to verify this effect on the characteristics of the formed materials. Samples were characterized by thermogravimetric analysis, X-ray diffractometry, UV, AFM and FT-IR spectroscopy.The experimental results reveal that, compared to the pure silk fibroin films, the mechanical strength of these regenerated SF/nano-TiO2 composite films were increased and the dissolubility in water of SF/nano-TiO2 composite films in aqueous solution were decreased. The diameter of nano-TiO2 particle films was about 80nm through UV and AFM. The nano-TiO2 particles were well dispersed in the regenerated silk fibroin. It was found that the crystal structures of the composite films were transited from typical Silk Ⅰ to typical Silk Ⅱ by the XRD and FTIR. Furthermore, the crystallinity of the composite films was obviously improved. Through the TGA, it was demonstrated that the heat transition temperature of composite films was also enhanced.