硝基苯类化合物的FMO位电荷密度能S_(Ei)~(HO)与生物毒性的QSAR研究

应用简易的量化方法计算了20多种硝基苯衍生物中的64个芳环FMO位电荷密度 能S_(Ei)~(HO)，用回归法建立了一个新的生物毒性评价方程，-lg LC_(50)=0. 6191log K_(ow)+0.1881S_(Ei)~(HO)+4.0894，应用所得方程，预测有机物的生物 毒性，方程对大多数化合物拟和很好。结果表明，所研究的有机物生物毒性同S_ (Ei)~(HO)和log K_(ow)密切相关，同化合物与酶的活性点复合或反应是生物中毒 的主要因素。     

取代基物化参数及其在药物定量构效关系中的应用

把取代基电性、立体及疏水性物化参数组合建立一种新取代基描述方法, 对环尿素类和N,N-二甲基-2-溴苯乙胺类衍生物进行结构表征. 对训练样本集通过逐步回归筛选变量, 所建多元线性回归方程R2分别为0.853和0.960, 留一法交互检验Rcv2分别为0.723和0.901；用预测集样本作外部预测, 所得Qext2分别为0.7617和0.7653. 结果显示：环尿素类化合物结构中苯环邻位立体、间位疏水、对位疏水及立体因素对该类药物抗HIV活性产生阻抑作用； N,N-二甲基-2-溴苯乙胺类苯环上取代基立体因素及对位给电子效应有利于提高肾上腺素能阻断活性.     

有机物对蝴蝶幼虫麻醉活性与结构参数的关系

应用量子化学HF/3-21G从头算法得到了20种有机分子的优势构象,利用HF/3-21G和分子图形学技术获得其电子结构参数和几何结构参数,并将这些参数与有机物对蝴蝶幼虫的麻醉活性相关联.结果表明,有机物麻醉活性与分子的范德华体积、分子最低空轨道能和分子偶极矩之间存在良好的多元线性相关性,成功地建立有机物对蝴蝶幼虫麻醉活性的构效关系式.     

腺苷激酶抑制剂的模拟设计

实验科学工作者们一直致力于寻找新的腺苷激酶抑制剂。这里我们分别从蛋白受体的分析，常规三维定量构效分析和引入分子对接的三维定量构效分析等多个角度及不同方法提出了一个更好更加可靠的抑制剂模型。     

CoMFA 3D-QSAR Analysis of Epothilones Based on Docking Conformation and Alignment

Epothilones belong to a class of novel microtubule stabilizing and anti-mitotic agents, which have a paclitaxel-like mechanism of action. A three-dimensional quantitative structure-activity relationship （3D-QSAR） model was built for epothilones by the method of comparative molecular field analysis （CoMFA） combined with the flexible docking technology. The docking CoMFA model gave a good cross-validated value of q2=0.784 with an optimized component of 6 and the conventional correlation coefficient of r^2=0.985. The statistical results show that the model has good ability to predict the activity of the studied compounds. At last, the docking CoMFA model was analyzed through contour maps complemented with MOLCAD-generated active site potential surface in the α,β-tubulin receptor, which can provide important information for the structure-based drug design.     

正丁基锂的直接碳谱测试与简易浓度定量探讨

1　引　　言核磁共振振碳谱是研究有机化合物强有力的工具。我们曾探讨不用氘代试剂且不经处理直接测试化合物碳谱的方法 ,本文中我们报告应用此方法来定量正丁基锂的浓度。正丁基锂的性质活泼易与空气反应 ,因此制备与储存均在乙醚等隋性溶液中进行。正丁基锂制备后以及长时间储存 ,使用前需要标定浓度 ,目前多采滴定法 ,经过两次滴定由公式推算得到浓度数据。本文探讨使用直接核磁共振碳谱对正丁基锂的浓度制定标准曲线图的可行性 ,实验表明使用标准曲线法可通过碳谱积分数据对正丁基锂的浓度进行定量分析。为了解碳谱分子间碳峰积分比值…     

基于三维静电势参数研究C60溶解性的构效关系

在量子化学从头算基础上,对一系列溶剂化合物分子进行了结构优化和三维静电势参数计算,运用多元线性回归分析和神经网络方法对C60在121种不同溶剂的溶解性与计算的结构参数进行了构效关系研究.用建立起来的QSPR 关系式对15种不同结构类型溶剂进行了预测,并阐述了C60溶质与不同溶剂之间的相互作用,获得了满意的结果.     

3D－QSAR Study on Diindolylmethane and Its Analogues with Comparative Molecular Field Analysis(CoMFA)

Comparative molecular field analysis (CoMFA),a three dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) method was applied to a series of diindolylmethane(DIM) analogs to study the relationship between their structure and their induction of CYP 1A1-associated ethoxyresorufin-O-deethylase(EROD) activity.A DISCO model of pharmacophore was derved to guide the superposition of the compounds.The coefficient of cross-validation (q^2) and non cross-validation(r^2) for the model established by the study are 0.827 and 0.988 respectively,the value of variance ratio (F) is 103.53 and standard error estimate (SEE)is 0.044.These values indicate that the CoMFA model derived is significant and might have a good prediction for the catalytic activity of DIM compounds.As a consequence,the predicted activity values of new designed compounds were all higher than that of the reported value.     

基于遗传算法的PTP1B抑制剂的二维定量构效关系研究

利用遗传算法,并结合线性回归和交叉验证方法,对一系列43个苯并呋喃/噻吩联二苯类PTP1B抑制剂作了二维定量构效关系的研究.计算得到了一组效果较好的定量构效关系模型.模型不仅具有好的回归能力,而且还具有很好的预测能力.同时,通过分析在遗传优化过程中参数在精华种群中所占的比例,还得到了可能对活性影响较大的成分.计算结果表明,分子的4个参数:lgP(分配系数)、Area（表面积）、MW（分子量）以及Dip（偶极距）是影响化合物活性的最重要的参数,这对抑制剂的设计和改造提供了指导.