细胞代谢组学用于木犀草素抑制MCF-7细胞的机制研究

基于气相色谱质谱联用(GC-MS)技术将代谢组学的方法结合细胞周期的实验,研究木犀草素作用于MCF-7细胞的作用机理。细胞活性实验验证,木犀草素对MCF-7细胞有抑制作用,GC-TOF/MS对加药细胞和未加药细胞代谢物进行指纹图谱分析,并进一步应用偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)对代谢组学数据进行多维统计分析。结合木犀草素将细胞周期抑制在S期(Synthesis),推测木犀草素通过阻碍核酸代谢中的磷酸戊糖途径抑制MCF-7细胞的增殖。     

石蜡包埋组织中组蛋白的提取分离和翻译后修饰的定量分析

组蛋白翻译后修饰(HPTMs)参与基因转录调控,其异常与肿瘤等重大疾病的发生发展密切相关。石蜡包埋组织是当前疾病研究的重要样本资源,对肿瘤机制和标志物研究具有重要意义。目前基于质谱的蛋白质组学技术已成为HPTMs分析的有力工具,而针对福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样品的HPTMs分析还十分有限。该研究发展了一种基于高效液相色谱-串联质谱的FFPE组织样本HPTMs分离分析新方法。通过研究并优化组蛋白的提取策略,建立了FFPE组织样本脱蜡水化处理、蛋白质提取与聚丙烯酰胺凝胶电泳分离相结合的组蛋白提取和分离方法。通过研究FFPE切片数量、组蛋白化学衍生化方法等对组蛋白鉴定的影响,确定了组蛋白处理的具体步骤。通过HPLC分离结合非依赖性采集模式的质谱分析,鉴定了组蛋白修饰的类型、位点和丰度。最后,将优化的实验方法应用于FFPE临床样本的HPTMs分析,鉴定了2例人乳腺浸润性癌和癌旁正常组织的HPTMs图谱,均获得了100种以上的不同组蛋白修饰形式的多肽。定量分析了他们的差异性水平,通过主成分降维分析,发现浸润性癌和癌旁正常组织之间组蛋白修饰丰度存在明显的差异,且差异性具有一定的规律,特别是涉及转录调控的组蛋白修饰与乳腺癌的预后和治疗靶点具有相关性,进而探讨了乳腺癌中异常HPTMs的生物学意义。该研究对临床石蜡样本中组蛋白修饰的分离分析以及肿瘤表观遗传标志物的检测进行了有益的探索。     

基于HOF-ATR-FTIR光谱学的乳腺癌的蛋白质二级结构变化及识别研究

衰减全反射傅里叶变换红外(ATR-FTIR)光谱技术可以用来直接测量生物组织的红外光谱.本研究首次采用自制的空心光纤(HOF)-ATR探针耦合FTIR光谱仪实现了健康和癌变乳腺组织原位光谱探测.利用去卷积、二阶导数和曲线拟合方法对所测光谱的酰胺Ⅰ带(1700-1600 cm-1)进行了分析,获得了乳腺组织中蛋白质各二级...     

剪切波弹性成像定量参数对良恶性乳腺肿块的鉴别及对乳腺癌术后复发的预测价值

探讨剪切波弹性成像定量参数对乳腺癌诊断和预后预测的作用.以乳腺癌患者60例作为观察组,乳腺良性结节患者60例作为对照组,利用剪切波弹性成像行超声检查,收集最大弹性模量值(Emax).t检验分析两组Emax差异,并使用ROC曲线分析Emax诊断乳腺癌的价值.结果显示,与对照组比较,观察组AE-max、Shell1Emax...     

乳腺癌组织成分变化的拉曼光谱学研究

拉曼光谱学技术可在分子层次上获取组织病变的微观信息.本研究采用显微拉曼光谱系统对20位患者的健康与癌变乳腺组织进行原位拉曼光谱探测,研究组织中生化成分的变化.对健康与癌变乳腺组织的平均拉曼光谱进行对比分析发现,相比于健康组织,癌变组织的光谱强度明显降低.比较两类组织的蛋白质成分与脂质成分的拉曼强度比值发现,癌变组织中的...     

乳腺癌病人单个细胞的Raman光谱

给出了乳腺癌病人正常乳腺细胞与癌细胞的拉曼光谱。从实验谱线中得到：癌变细胞的拉曼谱整体变弱, 就相对强度而言, DNA的2个磷酸根骨架峰782,1 084 cm-1和脱氧核糖-磷酸振动峰1 155及1 262 cm-1拉曼谱线明显的减少; 表征A型(DNA)构像的特征峰812 cm-1及谱线979,668 cm-1消失, 并有新峰1 175 cm-1出现, 905 cm-1的谱线增强并有6 cm-1的红移, 这说明DNA的磷酸根骨架有一定的断裂; 从而导致癌细胞的分裂繁殖失去有效的控制。在癌变组织细胞的拉曼谱中还发现了很强的一类与钙硬化密切相关的特征峰960 cm-1; 通过这些特征拉曼谱线的变化, 为癌症的诊断和治疗提供了有力的实验依据。     

基于长焦区聚焦换能器的扫描光声乳腺成像技术

报道了一种利用长焦区聚焦超声换能器检测光声信号的扫描光声乳腺成像系统.通过增加聚焦换能器焦区的长度,该技术可以快速实现对大块组织(如乳腺)的光声成像.测试结果表明,该实验系统能够对大块模拟样品中吸收体的位置、尺寸以及光能量吸收情况实现较为准确的成像.另外,实验中,该系统还可便捷地与传统的超声技术相结合,从而实现多模式复合的乳腺癌诊断.初步结果显示了该技术路线在乳腺癌早期诊断应用上的前景. 关键词： 乳腺癌诊断 光声成像 扫描光声层析术 脉冲回波法     

基于集成学习的抗乳腺癌候选药物定量构效关系模型

基于一系列作用于治疗乳腺癌重要靶标雌激素受体α亚型ERα的化合物,研究其分子结构和生物活性pIC₅₀之间的关系,构建抗乳腺癌候选药物定量构效关系模型.模型采用集成学习方法KNN-Bagging,通过组合多个KNN弱预测模型得到一个强集成器,实现对生物活性pIC₅₀的预测.基于集成学习的模型可决系数R²达到0.9496,均方根误差MSE达到0.0016,与传统多元线性回归,多元非线性回归相比,有统计学意义上的显著提升.说明定量构效关系模型在化合物分子描述符具有多种数据类型情况下,采用KNN-Bagging集成学习方法对治疗乳腺癌的重要靶标ERα的生物活性具有较好的预测能力,可为筛选拮抗ERα活性的化合物提供理论上的指导.     

乳腺癌患者化疗前后血清Ca、P、Mg、Zn含量与疗效的关系

目的探讨乳腺癌患者化疗效果对血清中钙(Ca)、磷(P)、镁(Mg)以及锌(Zn)含量的影响。方法选取普宁市人民医院进行化疗的乳腺癌患者80例作为化疗组,观察患者化疗前后血清中Ca、P、Mg以及Zn的水平变化,另选80例健康女性作为健康人组,检测其血清Ca、P、Mg、Zn水平,并进行对比分析。结果化疗组Ca、Mg含量明显低于健康人组(P0.05),Zn含量明显高于健康人组(P0.05),P含量与健康人组相比无统计学意义(P0.05);化疗后Ca、Mg含量显著高于化疗前(P0.05),Zn含量显著低于化疗前(P0.05),P含量略低于化疗前(P0.05)。结论血清Ca、P、Mg、Zn含量随着临床治疗效果所变化,可作为检测化疗效果的有效反应因子,在疗效判定方面具有一定的参考价值。     

基于不同电化学探针检测乳腺癌基因片段电化学传感器的研究

构建了以3种不同电活性物质(铁氰化钾平衡电对、亚甲基蓝和六氨合钌)为电化学信号探针,检测乳腺癌基因片段(乳腺癌DNA)的电化学传感器。利用吸附作用将探针ss DNA固定于金纳米-多壁碳纳米管-Nafion复合纳米材料修饰金电极表面,制备了DNA电化学传感器。采用循环伏安法、电化学阻抗法和微分脉冲伏安法,对DNA电化学传感器进行表征和定量分析。实验结果表明,在5 mmol/L K3[Fe(CN)6]-5mmol/L K4[Fe(CN)6]平衡电对电化学探针检测液中,乳腺癌DNA的线性范围为0.1~500.0 nmol/L,其检出限(S/N=3)为0.03 nmol/L。以20μmol/L亚甲基蓝为电化学探针检测液时,乳腺癌DNA的线性范围为1.0~500.0 nmol/L,检出限为0.3 nmol/L。利用50μmol/L六氨合钌电化学探针检测时,乳腺癌DNA的线性范围为1.0~500.0 nmol/L,检出限为0.3 nmol/L。3种电化学探针中,利用铁氰化钾平衡电对探针检测乳腺癌DNA的检出限最低,线性范围最宽。该传感器可用于其他DNA的检测分析。