A High-affinity Activator of G551D-CFTR Chloride Channel Identified By High Throughput Screening

A stably transfected CHO cell line coexpressing G551D-CFTR and iodide-sensitive yellow fluorescent protein mutant EYFP-H148Q-I152L was successfully established and used as assay model to identify smallmolecule activators of G551D-CFTR chloride channel from 100000 diverse combinatorial compounds by high throughput screening on a customized Beckman robotic system. A bicyclooctane compound was identified to activate G551D-CFTR chloride channel with high-affinity(Kd=1.8 μmol/L). The activity of the bicyclooctane compound is G551D-CFTR-specific, reversible and non-toxic. The G551D-CFTR activator may be useful as a tool to study the mutant G551D-CFTR chloride channel structure and transport properties and as a candidate drug to cure cystic fibrosis caused by G551D-CFTR mutation,     

Comparative Study of Variable Selection Using Genetic Algorithm with Various Types of Chromosomes

In this study,different methods of variable selection using the multilinear step-wise regression(MLR) and support vector regression(SVR) have been compared when the performance of genetic algorithms(GAs) using various types of chromosomes is used.The first method is a GA with binary chromosome(GA-BC) and the other is a GA with a fixed-length character chromosome(GA-FCC).The overall prediction accuracy for the training set by means of 7-fold cross-validation was tested.All the regression models were evaluated by the test set.The poor prediction for the test set illustrates that the forward stepwise regression(FSR) model is easier to overfit for the training set.The results using SVR methods showed that the over-fitting could be overcome.Further,the over-fitting would be easier for the GA-BC-SVR method because too many variables fleetly induced into the model.The final optimal model was obtained with good predictive ability(R2 = 0.885,S = 0.469,Rcv2 = 0.700,Scv = 0.757,Rex2 = 0.692,Sex = 0.675) using GA-FCC-SVR method.Our investigation indicates the variable selection method using GA-FCC is the most appropriate for MLR and SVR methods.     

人类基因组初期计划的结束--新的起点

最近的Nature杂志发表了一篇文章，宣告人类基因组常染色体测序的结束．渎者可能会产生疑问，人类基因组计划不是三年前就宣告结束了吗，这再一次的宣告结束是什么意思？其实，三年前结束的只是人类基因组的草图，草图留下了许多的缺憾．比如，在“常染色体”的部分（基因组富含基因的部分）碱基对缺失了10％．这已经不是个小数目，而整个基因组的碱基对则缺失了30％．当时的草图含有成千上万的间隙（未能测得碱基对顺序的区间）和被错误放置的区域。     

动物细胞凋亡相关基因p53和c-myc在大麦中的染色体定位

以人的原癌基因c myc和抑癌基因p53的cDNA为探针,经Southern杂交证明,它们在大麦基因组中存在同源序列.利用荧光原位杂交技术(FISH)进一步对大麦进行了染色体定位.在大麦有丝分裂中期染色体上p53有3个位点被检出,分别位于2L(第二染色体长臂)、2S(第二染色体短臂)和6L上,相应百分距离为84.27±0.75、46.24±15.44和19.23±0.53;c myc有2个位点被检出,分别位于5L和3S上,百分距离相应为75.90±6.62和47.63±5.20.利用改进的荧光原位杂交技术,使异源单拷贝或低拷贝基因在大麦姐妹染色单体上,同时出现信号的检出率达到了30%以上.     

玉米（Zea mays L．）cdc2基因的染色体原位杂交物理定位

首次报道了玉米低拷贝ｃｄｃ２基因非放射性标记的探针染色体原位杂交的物理定位．供试探针为玉米，ｐ３４ｃｄｃ２的ｃＤＮＡ克隆ｃｄｃ２ＺｍＡ，片段长度仅为１．３ｋｂ．原位杂交检测结果表明，该基因位置在第４染色体及第９染色体长臂，同时在第８染色体长臂亦有杂交信号检出．３处信号检出位置距着丝粒距离和长臂长度百分比分别为５４．７９±２．５１６，８７．９４±１．５３７和２５．８６±０．８５６在第４、９和８染色体上信号检出率分别为２４．６％，１２．３％和６．６％．本文还就非放射原位杂交技术以及ｃｄｃ２基因在玉米基因组中的物理位置与其功能间的关系作了探讨     

中国德昂族、景颇族、彝族人群染色体C带多态性定量分析研究

人类染色体结构异染色质(简称C带)的多态性，是群体可遗传特征，以往研究工作证明不同种族和人群之间存在着一定差异．我国幅员辽阔，民族众多．在一定隔离的生态环境中繁衍生息，形成各自不同的遗传类型，研究各民族间染色体C带的多态性，有助于认识民族差异的遗传基础，     

DNA双螺旋发现50周年

 2003年5月21日中国登山队的10名成员先后成功地登顶珠穆朗玛峰。在人类征服珠峰50周年之际,这一壮举极大地鼓舞了中国人民战胜非典的勇气和信心。1953年5月29日新西兰探险家希拉里和尼泊尔夏尔巴人诺尔盖首次将人类的足迹印在珠峰之巅,它提示人们:人类与自然相处既要以和谐为宗旨,不断丰富对自己家园的认识,又要有激情有挑战精神。1953年4月25日《Nature》周刊同时发表了3篇关于DNA螺旋结构的论文,作者分别是沃森和克里克、威尔金斯等、富兰克林(女)等。这3篇论文的发表,标志着人类在理解生命和保护生命的历程中迈出了关键的一步。     

中国鲤科鱼类染色体核仁组织区研究

总结了作者实验室对３６种鲤科鱼染色体核仁组织区（ＮＯＲ）研究结果．分析指出，中国鲤科鱼类ＮＯＲ的基本特征是，２对ＮＯＲ存在于亚中部着丝粒染色体上，属于较特化的类型．根据现有资料讨论了中国鲤科鱼类各亚科ＮＯＲ特征、ＮＯＲ异质性及变异机制     

基于二叉树的遗传算法求解设施平面布局优化

针对设施布局优化问题,使用二叉树的顺序遍历结构,结合设施顺序、相互关系及位置等因素形成新的染色体编码形式.以设施相邻性和随机原则相结合产生初始解,针对染色体的三段编码分别进行遗传操作,运用动态原则和反馈机制改进算法的惩罚函数.通过典型案例验算表明,本论文提出的算法在寻优效果和执行效率上有一定地改善.