DNA片段分选微流控芯片发展现状

新一代测序速度越来越快,费用不断降低,但整个流程中还有不少瓶颈.最耗时且影响测序准确度和重复性的环节之一,就是在文库制备过程中,对打断的大量基因组DNA片段进行基于传统凝胶电泳的手工操作筛选.近几年市场上出现了几种目标片段自动分选仪器,并迅速被多家国际知名测序中心引入测试,从而引起了广泛关注.本文评述了DNA片段分选发展经历,包括凝胶电泳、毛细管电泳、特别是微流控芯片在分选精度和通量上的不断提升,并简要论述了DNA分选目前尚存在的问题.     

国家自然科学基金委化学科学部分析化学学科介绍

分析化学在科学技术中不可或缺的作用和地位已是毋庸置疑的事实。上个世纪末“人类基因测序”被认为是一项像人类登月一样的伟大工程,在该工程面临进展缓慢的困难时,是分析化学家对毛细管电泳分析方法的重大革新,使这项伟大的工程得以提前完成,从而揭开了后基因时代的序幕。1999年比利时布鲁塞尔发生的二嗯英污染中毒事件引起全球消费者的恐慌,导致比利时内阁被迫集体辞职。     

单细胞化学蛋白质组新方法研究

近年来,从系统生物学角度研究基因、蛋白质和代谢物,即各种组学研究,为发现生命现象的化学基础提供了全新手段。比如时下颇为火热的基因组测序,已经发展到单细胞水平。由于蛋白质组的复杂性,单细胞蛋白质组分析要困难得多。国际上经典的单细胞蛋白质组学研究的方法主要是流式细胞术和化学细胞术两种。前者由美国Nolan小组提出,对于揭示疾病的分子信号通路网络具有重要科学价值,但蛋白质功能性标记方法非常繁琐复杂、且原代细胞的消     

纳米孔生物分子检测研究

纳米孔单分子检测技术是一种集操作简单、灵敏度高、检测速度快、无需标记等优点的传感检测技术,广泛应用于蛋白质检测、基因测序和标志物检测等领域。基因测序的费用、灵敏度和精度是该检测技术的发展中亟待解决的主要问题,而开发新型的纳米孔材料则是解决这些问题的关键手段。本文从纳米孔材料的选择和设计角度出发,综述了三种不同的纳米孔,即蛋白质等生物纳米孔、固态纳米孔和新型二维材料纳米孔在生物分子检测方面的应用现状,并比较了生物纳米孔与固态纳米孔的差别。本文也重点阐述了二维材料纳米孔在生物分子检测中的实验和模拟研究进展。最后,对纳米孔检测技术的发展前景进行了展望。     

碱基序列标记法结合焦磷酸测序测定不同来源基因表达量

建立了一种将序列标记反转录聚合酶链反应(PCR)与焦磷酸测序技术结合的相对基因表达量测定法(简称"SRPP").先用来源特异性引物对不同来源的同一基因通过反转录标记上特异性标签,PCR后用焦磷酸测序法对扩增产物进行序列解码,使得测序结果中的序列代表基因的来源,峰高代表基因在不同来源中的相对表达量.用实时荧光定量PCR法对本方法的准确性进行了验证,结果表明,SRPP可以同时准确测定同一基因在3个不同来源中的表达量,并实际测定了Egr1基因在糖尿病、肥胖和正常小鼠肝中的表达量差异.     

Schottky Barrier Height Modulation of Nickel Germanide Schottky Diodes by the Germanidation-Induced Dopant Segregation Technique

Modulation of Schottky barrier height （SBH） is successfully demonstrated by a germanidation-induced dopant segregation technique. The barrier height of NiGe/Ge Schottky diodes is modulated by 0.06-0.15 eV depending on annealing temperature. The results show the change of SBH is not attributed to the phase change of nickel germanides but to dopant segregation at the interface of germanides/germanium which causes the upward conduction energy band. In addition, we first observe a Raman peak at about 217cm^-1 corresponding to NiGe, which has not been reported till now. The surface morphology of nickel germanides can be improved by BF2 implantation before germanidation. The results may provide guidelines for the design of Sehottky source/drain germanium-based devices.     

基因测序拯救香蕉

 关于香蕉可能灭绝的说法似乎有些夸张。香蕉的基因测序工作最近已完成, 科学家希望借此获得新的抗性基因, 以使香蕉免受黄叶病和黑斑病这两种真菌疾病的威胁。世界上一半以上的香蕉都属于一个称为“卡文迪什”的品种, 没有种子而且不能进行有性繁殖, 这意味着它们在遗传基因上是相同的, 都要遭受这些真菌的威胁。     

(E)-2-乙氧基乙基-2-氰基-3-((4-(2,4-二氟苯氧基)苄基)氨基)-3-甲氧基丙烯酸酯对超螺旋质粒DNA的特异性切割(英文）

研究了一种新型丙烯酸酯 (E)-2-乙氧基乙基-2-氰基-3-((4-(2,4-二氟苯氧基)苄基)氨基)-3-甲氧基丙烯酸酯(MAZ)对超螺旋pUC19 DNA的定点切割作用。利用紫外吸收、荧光光谱、凝胶电泳和DNA测序技术研究其核酸切割特异性。紫外吸收光谱的红移和减色效应,以及静态荧光淬灭表明MAZ与DNA的作用属于典型的插入模式。不仅如此,凝胶电泳条带的变化以及DNA测序结果表明DNA的定点切割是通过DNA双链的分步水解完成。     

Construction and Cleavage Characterization of Single Targeted Multi-ribozyme Expression Systems in vitro

In order to clarify cleavage efficiency of a multi-ribozyme expression system on their substrates,plasmids containing 20 cis-acting hammerhead ribozymes for self-cleavage and 10 trans-acting hammerhead ribozymes targeted on MDR1 and MRP1 substrates,the target plasmids pGEM-MDR1 and pGEM-MRP1 were constructed by employing PCR and DNA recombination.The endonuclease's digestion and DNA sequencing confirmed exactness of the multi-ribozyme expression systems and the target plasmids.The repeated self-cleavage tes...     

鼠白细胞介素2真核表达质粒的构建及鉴定

利用小鼠IL－2基因构建真核表达质粒,筛选的阳性克隆经限制性内切酶酶切鉴定和基因测序,结果表明小鼠IL－2基因被正确地克隆支pCDNA3真核表达质粒上,将真核心质粒pCDNA2IL-2,转化大肠杆菌细胞,增菌培养后大量提取pCDNA3IL-2质粒,经紫外分光光度计检测其纯度和浓度,为加强控制害DNA疫苗的免疫功能奠定了科学的理论基础。