镰刀菌乙酰乳酸合成酶抑制剂的筛选及抗菌性分析

乙酰乳酸合成酶(Acetolactate synthase,ALS)是影响植物和微生物体内3种支链氨基酸生物合成第1阶段的关键性酶,已证实其为一种重要的除草剂靶标,并被广泛应用.禾谷镰刀菌是禾本科作物的重要病原菌之一,为了探索以ALS为靶标,开发禾谷镰刀菌病害防治药剂的可能性,根据已有ALS抑制剂的结构特点设计合成了14种嘧啶氧苄胺类化合物,以双草醚为对照,测定了它们对水稻、油菜和禾谷镰刀菌ALS的抑制效果.发现4种化合物对镰刀菌ALS都有抑制作用.并且,这4种化合物都能不同程度地抑制水稻ALS的活性,其中2种化合物能抑制油菜ALS的活性.通过分析这4种化合物对镰刀菌生长的抑制效果,可知它们对ALS与菌体的抑制效果存在差异,总体上对ALS的抑制效果更强.此外,针对化合物12#进行不同浓度的抗菌活性测定,发现该化合物的浓度与对镰刀菌生长的抑制率呈正相关.研究还表明,ALS对不同类型生物的抑制具有特异性,这为进一步开发以ALS为靶标的禾谷镰刀菌病害防治药剂提供了新的思路.     

毛秔子梢中天然高活性的神经氨酸酶抑制成分的研究

从天然产物中筛选高效低毒的神经氨酸酶抑制剂(NAI), 以期发现可抗流感病毒(H1N1)的化合物. 方法: 采用经典的NA活性检测实验(FL-MH-NANA method), 对从豆科植物毛秔子梢中分离得到10个化合物进行筛选, 检测这些化合物对NA的抑制活性. 结论: 化合物1, 2, 3, 5对流感病毒株的神经氨酸酶(NA)均具有抑制作用, 其中化合物1的抑制活性最强, 其IC₅₀值为16.76 μmol/L. 化合物1～4为新化合物, 化合物5～10为该植物中首次分得.     

含喹唑啉二酮片段的新型三酮类化合物的合成及生物活性

对羟苯基丙酮酸双氧化酶(EC 1.13.11.27, HPPD)是一个重要的除草剂作用靶标. 为了寻找具有高效除草活性的新型HPPD抑制剂, 在前期研究的基础上设计合成了24个含有喹唑啉二酮结构的三酮类化合物9a～9x. 所合成的化合物均经过¹H NMR, ¹³C NMR和 HRMS的表征. 以来源于拟南芥的HPPD (AtHPPD)为测试对象进行酶抑制活性筛选, 结果表明所合成的大部分化合物对AtHPPD均表现出了较好的抑制效果, 其中化合物9i的K_i 值为0.005 μmol/L, 显著优于商品化对照药剂硝磺草酮(K_i=0.013 μmol/L). 进一步温室盆栽筛选结果表明, 多数化合物在150 g ai/ha的剂量下对六种供试杂草中的至少一种表现出80%以上的防效, 特别是化合物9g在37.5 g ai/ha的低剂量下对所测试的六种杂草中的四种仍表现出了大于85%的抑制效果, 同时9g 在150 g ai/ha的剂量下对水稻和小麦均表现出了很好的作物安全性, 可以作为先导化合物供进一步深入研究.     

基于分子描述符和机器学习方法预测和虚拟筛选乳腺癌靶向蛋白HEC1抑制剂

HEC1(癌症高表达蛋白)是纺锤体检查点控制、着丝粒功能、细胞存活的关键的有丝分裂调节器,与原发性乳腺癌的不良预后有关.筛选具有高亲和力的HEC1新型抑制剂对探索乳腺癌的靶向治疗具有重要意义.本文从结构多样性的化合物库中筛选HEC1抑制剂.通过对分子描述符的特征筛选,采用支持向量机(SVM)和随机森林(RF)方法分别对HEC1抑制剂和非抑制剂建立了分类模型.经对比, RF模型显示了更好的预测精度.我们采用RF模型对HEC1抑制剂进行了虚拟筛选,从“in-house”实体库筛选得到2个潜在的HEC1抑制剂分子.随后对筛出的化合物进行了体外活性实验,发现对乳腺癌细胞株MDA-MB-468和MDA-MB-231均有一定程度的抗肿瘤活性.研究结果表明,机器学习方法对于设计和虚拟筛选HEC1抑制剂有良好的效果.     

基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf II型抑制剂活性

B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-Raf II型抑制剂为研究对象,联合应用分子对接和定量构效关系(QSAR)模型研究其定量构效关系去探讨抑制活性的起源.两个主题作为研究重点:生物活性构象和描述符.首先对分子对接方法(Glide、Gold、LigandFit、Cdocker和Libdock)进行准确性评价,后将研究的对象分子对接到B-Raf活性位点并获得生物活性构象.基于准确的对接结果,计算得到16个打分评价函数和21个能量描述符,以此构建定量构效关系模型. QSAR结果表明模型具有高度精确的拟合和强的预测能力(模型M1: r² = 0.852, r_(CV)² = 0.790, r_pre² = 0.864;模型M2: r² = 0.738, r_(CV)² = 0.812, r_pre² = 0.8605).同时探讨了对抑制活性有重要影响的描述符,结果表明打分评价函数(G_Score, -ECD, Dock_Score, PMF)与能量描述符(S(hb_ext), DE(int), Emodel)对抑制活性影响非常大.通过虚拟筛选和QSAR模型理论预测,一些新的具有潜在抑制活性的化合物作为B-Raf II型抑制剂被获得.上述信息对于进一步设计新颖高效的B-Raf II型抑制剂提供了有用的指导.     

分子对接与分子动力学模拟法探究PI3Kδ/度维利塞(Duvelisib)的选择性结合

大量研究表明磷脂酰肌醇3-激酶δ(PI3Kδ)与多种恶性肿瘤及免疫疾病的发生、发展密切相关,因此成为一个备受关注的药物靶点.伊德利塞(Idelalisib),PI3Kδ抑制剂,是首个被FDA批准上市的PI3K抑制剂,以此开启了PI3 Kδ选择性抑制剂开发的热潮,但是严重的毒副作用阻碍了该类化合物的使用.随后,度维利塞(...     

基因工程人表皮生长因子的分离纯化及其浓度的在线检测

在分离纯化快速开拓系统(AKTA explorer 100)中用凝胶(Sephadex G—50 superfine)纯化人表皮生长因子,并在优化的条件下对人表皮生长因子(hEGF)进行定量测定?与经离子交换柱、SDS—PAGE及凝胶图象扫描分析系统的人表皮生长因子标准品间相互印证。结果表明在优化条件下,在SDS—PAGE上可得到与标准样品hEGF一样清晰的单条带,其产品纯度高于94％,检出限可达1μg／mL。该法不仅对人表皮生长因子的在线检测行之有效,而且对其它蛋白质分离的在线检测也具有参考价值。     

α-卤代丁二酰氧肟酸类基质金属蛋白酶抑制剂的合成及活性评价

基质金属蛋白酶(MMPs)是一族Zn2+依赖的蛋白水解酶. 该族酶的过度表达与多种病理过程密切相关, 因此其抑制剂可用于这些疾病的治疗. 本文设计合成了15个α-卤代丁二酰氧肟酸类新型基质金属蛋白酶抑制剂, 经核磁共振氢谱和质谱进行了结构表征, 并以伊洛马司他(Ilomastat)为阳性对照, 分别测定了它们对基质金属蛋白酶MMP-2和MMP-9的体外抑制活性. 结果显示, 4个化合物对MMP-2的抑制活性与阳性对照相当; 5个化合物对MMP-9的抑制活性与对照药相当.     

磷酸二酯酶2 (PDE2)结构及其选择性抑制剂的研究进展

磷酸二酯酶2 (PDE2)主要分布在大脑、心脏细胞中, 作为潜在的药物靶标, 通过水解细胞内第二信使cAMP和cGMP, 对维持cAMP和cGMP的水平起着重要的作用, 其选择性抑制剂有望在内皮渗透性和改善记忆力等方面发挥作用. 综述了PDE2的组织分布、生理功能、催化区域和调节区域晶体结构的特点以及选择性的抑制剂. 最后, 根据药物设计发展的趋势对未来PDE2抑制剂的设计进行了展望.     

加速溶剂萃取-高效液相色谱-串联质谱法同时测定减肥保健食品中11种食欲抑制剂

建立了测定减肥保健食品中11种非法添加食欲抑制剂(芬氟拉明、苯丙醇胺、西布曲明、舍曲林、利莫那班、安非他酮、西酞普兰、氟西汀、苯氟雷司、托吡酯、唑尼沙胺)的高效液相色谱-串联质谱分析方法.不同类型的减肥保健食品经加速溶剂萃取后,以Waters Atlantis T3柱(150 mm×2.1 mm, 3 μm)分离,采用HPLC-MS/MS电喷雾电离,多反应监测模式检测,以保留时间和子离子比定性,外标法定量.11种食欲抑制剂的检出限为0.05～4.0 mg/kg;在低、中、高3个添加水平范围内的平均回收率为78.3%～103. 6%;日内精密度均小于12%,日间精密度均小于15%.本方法分析速度快、灵敏度高、重现性好,可用于不同减肥保健食品中非法添加食欲抑制剂的检测.