水合和pH对蛋白酶K热诱发转变影响的量热法研究

用差示扫描量热法, 在310～450 K温度范围、0.048～4.39克水/克干酶以及pH3～9范围内研究了蛋白酶K(EC 3.4.21.14)的热变性。分别提出表征热变性过程的三个主要热力学参数: 热变性温度T_d、比变性焓△H_d及超额表观比热C_(ex)~(max)和总水量h以及pH的关系。除Td和h的关系属于Flory-Garrett类型外, 蛋白酶K的热变性热力学特征和已报道的球蛋白、双螺旋蛋白及三螺旋蛋白不相同。一级水合水对蛋白酶K热变性热力学特征有最大的影响, pH也是影响该酶热稳定性的重要因素。     

一种新型氨基酸拓扑结构信息矢量及在肽定量构效关系研究中的应用

从表征分子的66个结构参量和拓扑指数出发,经主成分分析（PCA）得到一种包含134个氨基酸体系的特征描述子：氨基酸拓扑与结构信息矢量（VTSA）．将其应用于58个血管紧张素转化酶抑制剂（ACEI）和88个弹性蛋白酶模拟底物催化动力体系（ESCK）的定量构效关系（QSAR）或定量序效模拟（QSAM）研究中,结合遗传偏最小二乘（GPLS）、支持向量机回归（SVMR）以及本文设计的免疫神经网络（INN）技术,成功建立了上述两个肽类似物样本集定量预测模型,并取得优于已有文献报道的结果：ACEI,Rca^2≥0．82,Rcu^2≥0．77,Ermse≤0．44（GPLS＋SVM）;ESCK,Rcu^2≥0．84,Rcu^2≥0．82,Ermse≤0．20（GPLS＋INN）．     

2位仲羟基单取代的β-环糊精乙烯酯的结构分析

近年来环糊精因具有疏水性空腔,可应用在药物载体、手性物质的分离和吸附、与有机物和高分子形成稳定复合体、生物工程中酶的保护和酶活性的提高、模拟酶的研究等而受到广泛的关注.含有多个环糊精的线性聚合物,因具有更多的疏水性空腔,从而能增强环糊精的应用范围.乙烯基环糊精单酯是制备线性含有环糊精聚合物的重要单体.因环糊精中几个葡萄糖环中羟基的化学反应性质的相似性,利用一般的化学催化剂制备单取代的环糊精衍生物需要保护和去保护的多步反应.本文用酶做催化剂,在温和、简单易行条件下,制备了3种乙烯基的β-环糊精单酯.利用13C NMR、1H NMR、IR、MS和DSC对产物进行分析.在1H NMR中,酯化上的取代基与糖环上氢的积分面积之比和MS中分子离子峰的值证实是单取代产物;在13C NMR中,被取代的葡萄糖环上C-1的共振吸收峰向高场移动(δ=98.83),相应的C-2的共振吸收峰移向低场(δ=73.78);在1H NMR中,被取代的葡萄糖环上H-1峰出现在低场(δ=5.05).结果表明:3种乙烯基β-环糊精衍生物是单取代的酯并且取代位置发生在2位仲羟基上.     

木瓜蛋白酶的固定化研究

木瓜蛋白酶具有广谱的蛋白水解酶活性,广泛地应用于啤酒、饮料的澄清,肉类嫩化和复配消化药物等方面。近年来,为了扩大该酶在啤洒澄清上的应用,一些研究者致力于探索该酶的固定化研究,以提高该酶的利用效率,降低生产成本。     

固定化酶催化合成CCK-8C-端三肽衍生物

报道胆囊收缩素（CCK-8）C-末端片段三肽衍生物外Hpac-Met_Asp(Cam为起始 原料，采用三种固定化酶--α-糜蛋白酶／Celite-545、木瓜蛋白酶／VA-Epoxy、 步酶促反应得到目标三肽化合物．对酶的专一性、酶的固定化、溶剂选择和合成条 件等进行了研究，比较了自由酶法与固定化酶法的结果．     

Regiospecific Addition of Uracil to Acrylates Catalyzed by Alkaline Protease from Bacillus subtilis

Michael addition reactions of uracil to acrylates were catalyzed by an alkaline protease from Bacillus subtilis in dimethyl sulfoxide at 55℃ for 72h. The adducts were determined by TLC, IR and ^1 H NMR.     

酶促Michael-aldol串联反应合成四氢噻吩类化合物

在水介质和40℃条件下,碱性蛋白酶催化2,5-二羟基-1,4-二噻烷与N-苯基马来酰亚胺间的Michael-aldol反应,合成了四氢噻吩类化合物,反应取得了93%的产率及3∶1的非对映选择性。该方法具有反应条件温和、反应时间短、后处理简单等优点。     

枯草杆菌蛋白酶与3,4-二羟基-2-蒽醌磺酸钠的作用机理

积累平衡常数;枯草杆菌蛋白酶与3;4-二羟基-2-蒽醌磺酸钠的作用机理     

基质金属蛋白酶抑制剂设计的研究进展*

基质金属蛋白酶(MMP) 是一类含锌的水解酶, 过量的MMP会加速细胞外基质的降解并导致一系列的疾病, 例如癌症、关节炎和多发性硬化症等。因此MMP抑制剂的研究已成为药物设计研究领域中的一个热门课题。近年来, 科学家们发展了三种分子设计的方法, 包括基于底物的药物设计、基于结构的药物设计和组合化学技术。本文介绍了这些方法的原理及其在MMP抑制剂设计中的应用和进展。     

静电和疏水效应对SARS冠状病毒3CL蛋白酶二聚体稳定性的影响

从TGEV3CL蛋白酶二聚体结构出发,研究了TGEV3CL蛋白酶二聚体单体之间的静电和疏水相互作用.蛋白质的静电相互作用通过有限差分方法求解Poisson-Boltzmann方程得到,疏水相互作用通过分析溶剂可及性表面模型得到.考察了不同pH值对SARS3CL蛋白酶二聚体静电和疏水相互作用的影响,在pH=5.5～8.5时,二聚体静电相互作用能、静电去溶剂化能和疏水自由能都具有较小的数值,表明在该条件下静电和疏水相互作用有利于二聚体的稳定存在.由于SARS3CL蛋白酶活性模式为二聚体,因此,在该pH值范围内,有利于蛋白酶保持活性.在pH=7.0条件下,蛋白酶单体之间具有最强的静电和疏水相互作用,从而使蛋白酶具有最强的活性,这与实验结果相一致.pH值对静电去溶剂化能的影响大于疏水自由能,表明静电作用是造成强酸或强碱条件下二聚体不能稳定存在的主要原因.