Discovery of dipeptidyl peptidase Ⅳ(DPP4) inhibitors based on a novel indole scaffold

Dipeptidyl peptidase Ⅳ(DPP4) inhibitors are proven in the treatment of type 2 diabetes.We designed and synthesized a series of novel indole compounds that selectively inhibit the activity of DPP4 over dipeptidyl peptidase 9(DPP9)(200 fold).We further co-crystallized DPP4 with indole sulfonamide(compound 1) to confirm a proposed binding mode.Good metabolic stability of the indole compounds represents another positive attribute for further development.     

苯丙氨酸二肽类分子自组装:分子设计、结构调控与材料应用

近年来,苯丙氨酸二肽类分子的自组装研究受到了广泛关注,已成为超分子化学、生物材料科学研究的前沿领域之一。苯丙氨酸二肽类纳米组装体因具有结构多样、易功能化以及良好的生物相容性等优点,在纳米制造、组织修复等方面展示出巨大的应用潜力。本文从分子设计、组装结构调控与材料应用三个层次系统综述了苯丙氨酸二肽类分子自组装的研究进展。首先总结了苯丙氨酸二肽类分子的修饰改性,包括乙酰基、芳香环、氨基酸、短肽等基团。然后,重点介绍了苯丙氨酸二肽类分子自组装的调控策略和方法,如溶剂、界面、气相、多组分共组装和酶催化组装。最后,介绍了苯丙氨酸二肽类自组装材料在纳米材料合成、传感检测、药物传递及组织修复等方面的应用现状,并分析了该领域今后的发展方向。     

甘缬二肽-铜(Ⅱ)-多吡啶配合物合成、表征及与DNA的作用

本文合成了3个新的三元铜(Ⅱ)配合物：[Cu(Gly-L-Val)(Phen)]·3.5H₂O(1)、[Cu(Gly-L-Val)(TATP)]·2H₂O(2)和[Cu(Gly-L-Val)(DPPZ)]·1.5H₂O(3)[Gly-L-Val=甘缬二肽,Phen=1,10-邻菲咯啉,TATP=1,4,8,9-四氮三联苯,DPPZ=二吡啶并[3,2-a;2,3-c]吩嗪]。通过元素分析、红外光谱、紫外-可见光谱以及摩尔电导率测定对这些配合物进行了表征。采用电子吸收光谱、荧光光谱、粘度测定和琼脂凝胶电泳方法研究了这些配合物与DNA之间的相互作用。结果表明,这些配合物对DNA有较强的键合作用, 作用模式为插入作用;配合物在还原剂维生素C存在下对pBR322 DNA具有显著的断裂作用。配合物对DNA键合及断裂作用大小为配合物3＞2＞1。     

海洋真菌Penicillium sp.中的环二肽类化合物

从南海采集的海泥中分离得到的海洋真菌Penicillium sp.中分离得到3种环二肽类化合物。通过理化性质和波谱数据分析鉴定了3种化合物的结构。它们分别是3-异丁基-6-异丙基哌嗪-2,5-二酮(1)、3-另丁基-6-异丁基哌嗪-2,5-二酮(2)、3-另丁基-6-异丙基哌嗪-2,5-二酮(3)。     

α-氨基-β-酮酸酯(β-含氧二肽)的合成研究

对α-氨基-β-酮酸酯(β-含氧二肽)的合成进行了探讨.以Boc保护的(L)-缬氨酸及(L)-异亮氨酸为原料,分别与(D,L)-苏氨酸甲酯盐酸盐进行偶合,再用Dess-Martin试剂(DMP)氧化,分别以48%和38%的总收率得到相应的氨基酮酸酯二肽化合物.     

发展尿素与丙氨酸二肽相互作用的ABEEM/MM可极化力场

基于ABEEM/MM浮动电荷模型，尝试建立了一个新的可合理描述尿素-丙氨酸二肽-水分子之间相互作用的可极化力场.采用量子力学(QM)ωB97X-D/6-311++G(3df, 2p)//MP2/aug-cc-pVTZ方法对(Urea)(Ala)₂的结构、电荷分布及结合能进行计算，以及HF/STO-3G方法计算电荷分布.构建尿素-丙氨酸二肽-水体系的ABEEM/MM势能函数，基于QM计算结果，优选确定相关参数.结果表明，与QM相比，ABEEM/MM获得的(Urea)(Ala)₂的键长、键角、二面角和结合能的AAD(平均绝对偏差),RMSD(均方根偏差)和RRMSD(相对均方根偏差)分别为0.000 8 nm, 0.001 4 nm, 1.2%;1.36°,1.72°,1.5%;4.10°,5.56°,5.0%;6.07 kJ·mol^-1,6.82 kJ·mol^-1和10.2%,电荷分布的线性相关系数为0.988.将上述势能函数应用于(Ala)₂(Urea)₂...